data_ITX
# 
_chem_comp.id                                    ITX 
_chem_comp.name                                  "(1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(1R,2R)-2-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C25 H37 N3 O9 S" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2022-01-27 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2024-09-27 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        555.641 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     ITX 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   Y 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        7TQ5 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
_chem_comp.pdbx_pcm                              Y 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
ITX SG  S1  S 0 1 N Y N N N N 9.776  17.418 27.172 -4.639 -2.914 -0.601 SG  ITX 1  
ITX C01 C1  C 0 1 N N R N N N 8.962  18.445 28.404 -4.595 -1.340 -1.501 C01 ITX 2  
ITX C03 C2  C 0 1 N N S N N N 8.692  19.813 27.787 -4.782 -0.184 -0.516 C03 ITX 3  
ITX C04 C3  C 0 1 N N N N N N 7.663  19.715 26.595 -4.801 1.141  -1.283 C04 ITX 4  
ITX C05 C4  C 0 1 N N S N N N 7.253  21.056 25.995 -5.052 2.291  -0.306 C05 ITX 5  
ITX C06 C5  C 0 1 N N N N N N 6.324  20.940 24.761 -5.057 3.615  -1.038 C06 ITX 6  
ITX C08 C6  C 0 1 N N N N N N 5.345  22.661 26.150 -6.881 3.674  0.400  C08 ITX 7  
ITX C09 C7  C 0 1 N N N N N N 6.483  21.991 26.961 -6.471 2.187  0.300  C09 ITX 8  
ITX C12 C8  C 0 1 N N N N N N 10.493 21.549 27.863 -2.403 -0.097 0.006  C12 ITX 9  
ITX C13 C9  C 0 1 N N S N N N 11.814 22.071 27.219 -1.262 -0.204 0.984  C13 ITX 10 
ITX C14 C10 C 0 1 N N N N N N 12.925 21.843 28.225 -1.368 0.920  2.016  C14 ITX 11 
ITX C15 C11 C 0 1 N N N N N N 14.294 22.258 27.733 -0.283 0.739  3.080  C15 ITX 12 
ITX C16 C12 C 0 1 N N N N N N 15.330 22.256 28.898 -0.309 1.929  4.042  C16 ITX 13 
ITX C17 C13 C 0 1 N N N N N N 14.809 21.420 26.568 -0.543 -0.552 3.859  C17 ITX 14 
ITX C19 C14 C 0 1 N N N N N N 10.694 23.979 26.054 1.128  -0.633 0.782  C19 ITX 15 
ITX C21 C15 C 0 1 N N N N N N 9.554  25.850 25.002 3.461  -1.137 0.737  C21 ITX 16 
ITX C22 C16 C 0 1 N N R N N N 9.557  27.373 24.795 4.685  -0.915 -0.153 C22 ITX 17 
ITX C23 C17 C 0 1 N N R N N N 10.876 28.191 24.523 6.040  -1.385 0.379  C23 ITX 18 
ITX C24 C18 C 0 1 N N N N N N 9.818  28.079 23.488 5.355  -2.151 -0.755 C24 ITX 19 
ITX C25 C19 C 0 1 Y N N N N N 11.403 29.486 25.111 7.251  -0.559 0.029  C25 ITX 20 
ITX C26 C20 C 0 1 Y N N N N N 12.480 29.404 26.031 8.013  0.008  1.033  C26 ITX 21 
ITX C27 C21 C 0 1 Y N N N N N 13.046 30.509 26.667 9.123  0.766  0.714  C27 ITX 22 
ITX C28 C22 C 0 1 Y N N N N N 12.569 31.815 26.429 9.472  0.958  -0.615 C28 ITX 23 
ITX C30 C23 C 0 1 N N N N N N 14.499 33.243 26.908 10.863 1.859  -2.319 C30 ITX 24 
ITX C31 C24 C 0 1 Y N N N N N 11.486 31.923 25.528 8.706  0.388  -1.620 C31 ITX 25 
ITX C32 C25 C 0 1 Y N N N N N 10.931 30.789 24.909 7.600  -0.374 -1.296 C32 ITX 26 
ITX N07 N1  N 0 1 N N N N N N 5.291  21.874 24.915 -6.094 4.366  -0.627 N07 ITX 27 
ITX N11 N2  N 0 1 N N N N N N 9.923  20.412 27.291 -3.675 -0.176 0.444  N11 ITX 28 
ITX N18 N3  N 0 1 N N N N N N 11.654 23.519 26.920 0.009  -0.088 0.264  N18 ITX 29 
ITX O02 O1  O 0 1 N N N N N N 9.861  18.639 29.466 -5.646 -1.315 -2.469 O02 ITX 30 
ITX O10 O2  O 0 1 N N N N N N 6.479  20.215 23.841 -4.244 3.951  -1.873 O10 ITX 31 
ITX O20 O3  O 0 1 N N N N N N 10.420 25.351 26.042 2.297  -0.526 0.121  O20 ITX 32 
ITX O29 O4  O 0 1 N N N N N N 13.127 32.915 27.071 10.564 1.704  -0.931 O29 ITX 33 
ITX O33 O5  O 0 1 N N N N N N 10.099 23.215 25.325 1.083  -1.220 1.844  O33 ITX 34 
ITX O34 O6  O 0 1 N N N N N N 10.021 22.115 28.799 -2.178 0.061  -1.175 O34 ITX 35 
ITX H2  H2  H 0 1 N N N N N N 8.029  17.946 28.704 -3.634 -1.236 -2.005 H2  ITX 36 
ITX H3  H3  H 0 1 N N N N N N 8.254  20.463 28.558 -5.725 -0.309 0.016  H3  ITX 37 
ITX H4  H4  H 0 1 N N N N N N 6.757  19.214 26.965 -3.841 1.288  -1.778 H4  ITX 38 
ITX H5  H5  H 0 1 N N N N N N 8.118  19.108 25.798 -5.595 1.117  -2.029 H5  ITX 39 
ITX H6  H6  H 0 1 N N N N N N 8.167  21.581 25.678 -4.300 2.292  0.483  H6  ITX 40 
ITX H7  H7  H 0 1 N N N N N N 5.583  23.713 25.935 -7.946 3.786  0.198  H7  ITX 41 
ITX H8  H8  H 0 1 N N N N N N 4.390  22.605 26.693 -6.641 4.065  1.388  H8  ITX 42 
ITX H9  H9  H 0 1 N N N N N N 6.059  21.407 27.791 -7.140 1.642  -0.366 H9  ITX 43 
ITX H10 H10 H 0 1 N N N N N N 7.161  22.759 27.361 -6.441 1.724  1.286  H10 ITX 44 
ITX H11 H11 H 0 1 N N N N N N 12.019 21.508 26.296 -1.306 -1.168 1.490  H11 ITX 45 
ITX H12 H12 H 0 1 N N N N N N 12.694 22.420 29.133 -1.234 1.882  1.521  H12 ITX 46 
ITX H13 H13 H 0 1 N N N N N N 12.956 20.771 28.470 -2.349 0.888  2.489  H13 ITX 47 
ITX H14 H14 H 0 1 N N N N N N 14.215 23.296 27.378 0.693  0.683  2.598  H14 ITX 48 
ITX H15 H15 H 0 1 N N N N N N 14.947 22.863 29.731 -1.285 1.985  4.524  H15 ITX 49 
ITX H16 H16 H 0 1 N N N N N N 15.493 21.224 29.242 0.464  1.800  4.800  H16 ITX 50 
ITX H17 H17 H 0 1 N N N N N N 16.281 22.679 28.543 -0.124 2.849  3.487  H17 ITX 51 
ITX H18 H18 H 0 1 N N N N N N 15.804 21.780 26.268 -0.525 -1.400 3.174  H18 ITX 52 
ITX H19 H19 H 0 1 N N N N N N 14.878 20.366 26.877 0.230  -0.681 4.617  H19 ITX 53 
ITX H20 H20 H 0 1 N N N N N N 14.116 21.508 25.718 -1.519 -0.496 4.341  H20 ITX 54 
ITX H21 H21 H 0 1 N N N N N N 8.525  25.546 25.246 3.289  -2.207 0.858  H21 ITX 55 
ITX H22 H22 H 0 1 N N N N N N 9.860  25.381 24.055 3.634  -0.685 1.714  H22 ITX 56 
ITX H23 H23 H 0 1 N N N N N N 8.855  27.904 25.455 4.669  -0.007 -0.756 H23 ITX 57 
ITX H24 H24 H 0 1 N N N N N N 11.705 27.498 24.314 6.059  -1.854 1.363  H24 ITX 58 
ITX H25 H25 H 0 1 N N N N N N 9.223  28.966 23.226 4.923  -3.124 -0.518 H25 ITX 59 
ITX H26 H26 H 0 1 N N N N N N 10.009 27.485 22.582 5.780  -2.057 -1.755 H26 ITX 60 
ITX H27 H27 H 0 1 N N N N N N 12.886 28.428 26.252 7.741  -0.141 2.067  H27 ITX 61 
ITX H28 H28 H 0 1 N N N N N N 13.865 30.362 27.355 9.719  1.209  1.499  H28 ITX 62 
ITX H29 H29 H 0 1 N N N N N N 14.734 34.142 27.497 11.039 0.880  -2.765 H29 ITX 63 
ITX H30 H30 H 0 1 N N N N N N 15.120 32.404 27.255 10.024 2.342  -2.820 H30 ITX 64 
ITX H31 H31 H 0 1 N N N N N N 14.706 33.437 25.845 11.756 2.475  -2.432 H31 ITX 65 
ITX H32 H32 H 0 1 N N N N N N 11.075 32.898 25.310 8.975  0.536  -2.656 H32 ITX 66 
ITX H33 H33 H 0 1 N N N N N N 10.094 30.931 24.241 7.005  -0.822 -2.079 H33 ITX 67 
ITX H34 H34 H 0 1 N N N N N N 4.570  21.995 24.233 -6.296 5.253  -0.966 H34 ITX 68 
ITX H35 H35 H 0 1 N N N N N N 10.379 19.990 26.507 -3.859 -0.228 1.395  H35 ITX 69 
ITX H36 H36 H 0 1 N N N N N N 12.264 24.176 27.363 0.046  0.381  -0.584 H36 ITX 70 
ITX H37 H37 H 0 1 N N N N N N 9.453  19.180 30.132 -5.682 -0.501 -2.989 H37 ITX 71 
ITX O2  O7  O 0 1 N Y N N N N ?      ?      ?      -3.485 -2.819 0.387  O2  ITX 72 
ITX O3  O8  O 0 1 N Y N N N N ?      ?      ?      -5.797 -2.987 0.220  O3  ITX 73 
ITX O1  O9  O 0 1 N Y N N N N 9.730  15.796 27.960 -4.280 -3.989 -1.458 O1  ITX 74 
ITX H1  H1  H 0 1 N Y N N N N ?      ?      ?      -3.382 -3.600 0.947  H1  ITX 75 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
ITX C24 C23 SING N N 1  
ITX C24 C22 SING N N 2  
ITX O10 C06 DOUB N N 3  
ITX C23 C22 SING N N 4  
ITX C23 C25 SING N N 5  
ITX C06 N07 SING N N 6  
ITX C06 C05 SING N N 7  
ITX C22 C21 SING N N 8  
ITX C32 C25 DOUB Y N 9  
ITX C32 C31 SING Y N 10 
ITX N07 C08 SING N N 11 
ITX C21 O20 SING N N 12 
ITX C25 C26 SING Y N 13 
ITX O33 C19 DOUB N N 14 
ITX C31 C28 DOUB Y N 15 
ITX C05 C04 SING N N 16 
ITX C05 C09 SING N N 17 
ITX C26 C27 DOUB Y N 18 
ITX O20 C19 SING N N 19 
ITX C19 N18 SING N N 20 
ITX C08 C09 SING N N 21 
ITX C28 C27 SING Y N 22 
ITX C28 O29 SING N N 23 
ITX C17 C15 SING N N 24 
ITX C04 C03 SING N N 25 
ITX C30 O29 SING N N 26 
ITX N18 C13 SING N N 27 
ITX SG  C01 SING N N 28 
ITX C13 C12 SING N N 29 
ITX C13 C14 SING N N 30 
ITX N11 C03 SING N N 31 
ITX N11 C12 SING N N 32 
ITX C15 C14 SING N N 33 
ITX C15 C16 SING N N 34 
ITX C03 C01 SING N N 35 
ITX C12 O34 DOUB N N 36 
ITX C01 O02 SING N N 37 
ITX C01 H2  SING N N 38 
ITX C03 H3  SING N N 39 
ITX C04 H4  SING N N 40 
ITX C04 H5  SING N N 41 
ITX C05 H6  SING N N 42 
ITX C08 H7  SING N N 43 
ITX C08 H8  SING N N 44 
ITX C09 H9  SING N N 45 
ITX C09 H10 SING N N 46 
ITX C13 H11 SING N N 47 
ITX C14 H12 SING N N 48 
ITX C14 H13 SING N N 49 
ITX C15 H14 SING N N 50 
ITX C16 H15 SING N N 51 
ITX C16 H16 SING N N 52 
ITX C16 H17 SING N N 53 
ITX C17 H18 SING N N 54 
ITX C17 H19 SING N N 55 
ITX C17 H20 SING N N 56 
ITX C21 H21 SING N N 57 
ITX C21 H22 SING N N 58 
ITX C22 H23 SING N N 59 
ITX C23 H24 SING N N 60 
ITX C24 H25 SING N N 61 
ITX C24 H26 SING N N 62 
ITX C26 H27 SING N N 63 
ITX C27 H28 SING N N 64 
ITX C30 H29 SING N N 65 
ITX C30 H30 SING N N 66 
ITX C30 H31 SING N N 67 
ITX C31 H32 SING N N 68 
ITX C32 H33 SING N N 69 
ITX N07 H34 SING N N 70 
ITX N11 H35 SING N N 71 
ITX N18 H36 SING N N 72 
ITX O02 H37 SING N N 73 
ITX SG  O2  SING N N 74 
ITX SG  O3  DOUB N N 75 
ITX SG  O1  DOUB N N 76 
ITX O2  H1  SING N N 77 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
ITX SMILES           ACDLabs              12.01 "COc1ccc(cc1)C1CC1COC(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC1CCNC1=O)C(O)S(=O)(=O)O"                                                                                                                                                                                    
ITX InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C25H37N3O9S/c1-14(2)10-20(23(30)27-21(24(31)38(33,34)35)12-16-8-9-26-22(16)29)28-25(32)37-13-17-11-19(17)15-4-6-18(36-3)7-5-15/h4-7,14,16-17,19-21,24,31H,8-13H2,1-3H3,(H,26,29)(H,27,30)(H,28,32)(H,33,34,35)/t16-,17-,19-,20-,21-,24+/m0/s1" 
ITX InChIKey         InChI                1.03  GJLMLKMKSRQJFM-HDBZVZNMSA-N                                                                                                                                                                                                                              
ITX SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "COc1ccc(cc1)[C@@H]2C[C@H]2COC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C[C@@H]3CCNC3=O)[C@H](O)[S](O)(=O)=O"                                                                                                                                                      
ITX SMILES           CACTVS               3.385 "COc1ccc(cc1)[CH]2C[CH]2COC(=O)N[CH](CC(C)C)C(=O)N[CH](C[CH]3CCNC3=O)[CH](O)[S](O)(=O)=O"                                                                                                                                                                
ITX SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C[C@@H]1CCNC1=O)[C@H](O)S(=O)(=O)O)NC(=O)OC[C@@H]2C[C@H]2c3ccc(cc3)OC"                                                                                                                                                        
ITX SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CC(C)CC(C(=O)NC(CC1CCNC1=O)C(O)S(=O)(=O)O)NC(=O)OCC2CC2c3ccc(cc3)OC"                                                                                                                                                                                    
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
ITX "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "(1R,2S)-1-hydroxy-2-{[N-({[(1R,2R)-2-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]methoxy}carbonyl)-L-leucyl]amino}-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid"                                                
ITX "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "(1~{R},2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[(1~{R},2~{R})-2-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]methoxycarbonylamino]-4-methyl-pentanoyl]amino]-1-oxidanyl-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propane-1-sulfonic acid" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
ITX "Create component" 2022-01-27 RCSB 
ITX "Initial release"  2022-02-09 RCSB 
ITX "Modify PCM"       2024-09-27 PDBE 
# 
_pdbx_chem_comp_pcm.pcm_id                             1 
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id                            ITX 
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id                CYS 
_pdbx_chem_comp_pcm.type                               None 
_pdbx_chem_comp_pcm.category                           "Covalent chemical modification" 
_pdbx_chem_comp_pcm.position                           "Amino-acid side chain" 
_pdbx_chem_comp_pcm.polypeptide_position               "Any position" 
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id_linking_atom               C01 
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id_linking_atom   SG 
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_specific_ptm_accession     ? 
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_generic_ptm_accession      ? 
# 
