data_6GK
# 
_chem_comp.id                                    6GK 
_chem_comp.name                                  "6-(2-methoxyphenyl)-N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]pyrimidine-2,4-diamine" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C23 H22 N6 O" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2016-04-06 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2017-03-03 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        398.460 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     6GK 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5J5H 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
6GK C10 C1  C 0 1 Y N N -12.660 -1.623 -58.404 0.546  0.291  -0.416 C10 6GK 1  
6GK C13 C2  C 0 1 Y N N -12.663 1.542  -58.045 3.537  1.454  0.072  C13 6GK 2  
6GK C15 C3  C 0 1 Y N N -11.591 3.669  -58.448 5.028  2.262  1.752  C15 6GK 3  
6GK C17 C4  C 0 1 Y N N -10.811 2.259  -56.705 3.496  3.693  0.610  C17 6GK 4  
6GK C20 C5  C 0 1 Y N N -11.742 -0.828 -53.939 0.511  -4.318 -0.721 C20 6GK 5  
6GK C21 C6  C 0 1 Y N N -12.069 -1.926 -53.148 1.623  -5.026 -1.134 C21 6GK 6  
6GK C22 C7  C 0 1 Y N N -13.136 -2.731 -53.528 2.885  -4.510 -0.881 C22 6GK 7  
6GK C01 C8  C 0 1 N N N -12.118 -7.144 -61.180 -5.659 1.979  -1.025 C01 6GK 8  
6GK O01 O1  O 0 1 N N N -11.626 -6.007 -60.484 -4.363 1.462  -0.715 O01 6GK 9  
6GK C02 C9  C 0 1 Y N N -11.622 -6.246 -59.142 -4.291 0.527  0.266  C02 6GK 10 
6GK C07 C10 C 0 1 Y N N -11.534 -7.540 -58.638 -5.442 0.113  0.919  C07 6GK 11 
6GK C06 C11 C 0 1 Y N N -11.536 -7.732 -57.262 -5.367 -0.839 1.918  C06 6GK 12 
6GK C05 C12 C 0 1 Y N N -11.626 -6.651 -56.388 -4.146 -1.385 2.273  C05 6GK 13 
6GK C04 C13 C 0 1 Y N N -11.726 -5.368 -56.895 -2.992 -0.983 1.631  C04 6GK 14 
6GK C03 C14 C 0 1 Y N N -11.729 -5.155 -58.269 -3.056 -0.028 0.618  C03 6GK 15 
6GK C08 C15 C 0 1 Y N N -11.812 -3.834 -58.688 -1.821 0.402  -0.078 C08 6GK 16 
6GK C11 C16 C 0 1 Y N N -12.626 -2.950 -57.996 -0.588 -0.146 0.268  C11 6GK 17 
6GK N01 N1  N 0 1 Y N N -11.077 -3.383 -59.712 -1.874 1.320  -1.045 N01 6GK 18 
6GK C09 C17 C 0 1 Y N N -11.135 -2.107 -60.099 -0.774 1.716  -1.664 C09 6GK 19 
6GK N02 N2  N 0 1 N N N -10.403 -1.692 -61.127 -0.870 2.670  -2.662 N02 6GK 20 
6GK N03 N3  N 0 1 Y N N -11.919 -1.247 -59.456 0.415  1.213  -1.365 N03 6GK 21 
6GK N04 N4  N 0 1 N N N -13.441 -0.721 -57.791 1.794  -0.226 -0.107 N04 6GK 22 
6GK C18 C18 C 0 1 N N N -14.249 -1.044 -56.602 1.917  -1.314 0.866  C18 6GK 23 
6GK C19 C19 C 0 1 Y N N -13.499 -1.323 -55.462 1.824  -2.638 0.153  C19 6GK 24 
6GK N06 N5  N 0 1 Y N N -12.479 -0.538 -55.098 0.640  -3.162 -0.099 N06 6GK 25 
6GK C23 C20 C 0 1 Y N N -13.849 -2.425 -54.682 2.982  -3.296 -0.220 C23 6GK 26 
6GK C12 C21 C 0 1 N N N -13.666 0.623  -58.373 2.992  0.317  -0.753 C12 6GK 27 
6GK N05 N6  N 0 1 Y N N -11.801 1.321  -57.039 3.050  2.668  -0.090 N05 6GK 28 
6GK C16 C22 C 0 1 Y N N -10.694 3.446  -57.414 4.491  3.525  1.554  C16 6GK 29 
6GK C14 C23 C 0 1 Y N N -12.570 2.725  -58.764 4.538  1.210  0.994  C14 6GK 30 
6GK H1  H1  H 0 1 N N N -11.531 4.585  -59.017 5.807  2.101  2.483  H1  6GK 31 
6GK H2  H2  H 0 1 N N N -10.134 2.055  -55.889 3.072  4.674  0.449  H2  6GK 32 
6GK H3  H3  H 0 1 N N N -10.914 -0.194 -53.658 -0.475 -4.713 -0.913 H3  6GK 33 
6GK H4  H4  H 0 1 N N N -11.504 -2.148 -52.255 1.511  -5.970 -1.646 H4  6GK 34 
6GK H5  H5  H 0 1 N N N -13.410 -3.588 -52.931 3.773  -5.042 -1.192 H5  6GK 35 
6GK H6  H6  H 0 1 N N N -12.117 -6.941 -62.261 -5.575 2.716  -1.824 H6  6GK 36 
6GK H7  H7  H 0 1 N N N -11.474 -8.010 -60.969 -6.307 1.165  -1.349 H7  6GK 37 
6GK H8  H8  H 0 1 N N N -13.144 -7.361 -60.848 -6.083 2.451  -0.139 H8  6GK 38 
6GK H9  H9  H 0 1 N N N -11.465 -8.384 -59.308 -6.398 0.536  0.647  H9  6GK 39 
6GK H10 H10 H 0 1 N N N -11.467 -8.734 -56.864 -6.266 -1.158 2.424  H10 6GK 40 
6GK H11 H11 H 0 1 N N N -11.618 -6.814 -55.320 -4.096 -2.128 3.055  H11 6GK 41 
6GK H12 H12 H 0 1 N N N -11.802 -4.528 -56.221 -2.041 -1.411 1.911  H12 6GK 42 
6GK H13 H13 H 0 1 N N N -13.220 -3.286 -57.159 -0.512 -0.890 1.046  H13 6GK 43 
6GK H14 H14 H 0 1 N N N -9.873  -2.458 -61.490 -1.735 3.038  -2.900 H14 6GK 44 
6GK H15 H15 H 0 1 N N N -11.004 -1.335 -61.842 -0.071 2.970  -3.124 H15 6GK 45 
6GK H16 H16 H 0 1 N N N -14.901 -0.186 -56.384 2.878  -1.241 1.374  H16 6GK 46 
6GK H17 H17 H 0 1 N N N -14.866 -1.925 -56.833 1.112  -1.239 1.598  H17 6GK 47 
6GK H18 H18 H 0 1 N N N -14.682 -3.046 -54.977 3.948  -2.862 -0.011 H18 6GK 48 
6GK H19 H19 H 0 1 N N N -14.627 1.008  -58.002 2.735  0.680  -1.748 H19 6GK 49 
6GK H20 H20 H 0 1 N N N -13.707 0.527  -59.468 3.746  -0.466 -0.836 H20 6GK 50 
6GK H21 H21 H 0 1 N N N -9.931  4.171  -57.169 4.846  4.367  2.130  H21 6GK 51 
6GK H22 H22 H 0 1 N N N -13.259 2.917  -59.573 4.932  0.213  1.122  H22 6GK 52 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
6GK C01 O01 SING N N 1  
6GK N02 C09 SING N N 2  
6GK O01 C02 SING N N 3  
6GK C09 N01 DOUB Y N 4  
6GK C09 N03 SING Y N 5  
6GK N01 C08 SING Y N 6  
6GK N03 C10 DOUB Y N 7  
6GK C02 C07 DOUB Y N 8  
6GK C02 C03 SING Y N 9  
6GK C14 C15 DOUB Y N 10 
6GK C14 C13 SING Y N 11 
6GK C08 C03 SING N N 12 
6GK C08 C11 DOUB Y N 13 
6GK C07 C06 SING Y N 14 
6GK C15 C16 SING Y N 15 
6GK C10 C11 SING Y N 16 
6GK C10 N04 SING N N 17 
6GK C12 C13 SING N N 18 
6GK C12 N04 SING N N 19 
6GK C03 C04 DOUB Y N 20 
6GK C13 N05 DOUB Y N 21 
6GK N04 C18 SING N N 22 
6GK C16 C17 DOUB Y N 23 
6GK C06 C05 DOUB Y N 24 
6GK N05 C17 SING Y N 25 
6GK C04 C05 SING Y N 26 
6GK C18 C19 SING N N 27 
6GK C19 N06 DOUB Y N 28 
6GK C19 C23 SING Y N 29 
6GK N06 C20 SING Y N 30 
6GK C23 C22 DOUB Y N 31 
6GK C20 C21 DOUB Y N 32 
6GK C22 C21 SING Y N 33 
6GK C15 H1  SING N N 34 
6GK C17 H2  SING N N 35 
6GK C20 H3  SING N N 36 
6GK C21 H4  SING N N 37 
6GK C22 H5  SING N N 38 
6GK C01 H6  SING N N 39 
6GK C01 H7  SING N N 40 
6GK C01 H8  SING N N 41 
6GK C07 H9  SING N N 42 
6GK C06 H10 SING N N 43 
6GK C05 H11 SING N N 44 
6GK C04 H12 SING N N 45 
6GK C11 H13 SING N N 46 
6GK N02 H14 SING N N 47 
6GK N02 H15 SING N N 48 
6GK C18 H16 SING N N 49 
6GK C18 H17 SING N N 50 
6GK C23 H18 SING N N 51 
6GK C12 H19 SING N N 52 
6GK C12 H20 SING N N 53 
6GK C16 H21 SING N N 54 
6GK C14 H22 SING N N 55 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
6GK SMILES           ACDLabs              12.01 "c2(cc(c1c(OC)cccc1)nc(n2)N)N(Cc3ncccc3)Cc4ncccc4"                                                                                                  
6GK InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C23H22N6O/c1-30-21-11-3-2-10-19(21)20-14-22(28-23(24)27-20)29(15-17-8-4-6-12-25-17)16-18-9-5-7-13-26-18/h2-14H,15-16H2,1H3,(H2,24,27,28)" 
6GK InChIKey         InChI                1.03  BOPSVMQMLOGQBG-UHFFFAOYSA-N                                                                                                                         
6GK SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "COc1ccccc1c2cc(nc(N)n2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                                      
6GK SMILES           CACTVS               3.385 "COc1ccccc1c2cc(nc(N)n2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                                      
6GK SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "COc1ccccc1c2cc(nc(n2)N)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                                      
6GK SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "COc1ccccc1c2cc(nc(n2)N)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                                      
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
6GK "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "6-(2-methoxyphenyl)-N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]pyrimidine-2,4-diamine" 
6GK "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "6-(2-methoxyphenyl)-~{N}4,~{N}4-bis(pyridin-2-ylmethyl)pyrimidine-2,4-diamine" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
6GK "Create component" 2016-04-06 RCSB 
6GK "Initial release"  2017-03-08 RCSB 
# 
