data_6GH
# 
_chem_comp.id                                    6GH 
_chem_comp.name                                  "N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]-6-(thiophen-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C20 H18 N6 S" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2016-04-06 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2017-03-03 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        374.462 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     6GH 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5J5F 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
6GH C10 C1  C 0 1 Y N N 44.075 -22.515 136.274 -1.905 -3.633 -0.002 C10 6GH 1  
6GH C13 C2  C 0 1 Y N N 39.841 -18.478 132.868 -4.330 0.488  -1.153 C13 6GH 2  
6GH C15 C3  C 0 1 Y N N 41.351 -18.328 131.004 -4.752 2.787  -1.613 C15 6GH 3  
6GH C17 C4  C 0 1 Y N N 40.580 -25.991 135.104 3.309  0.903  -0.227 C17 6GH 4  
6GH C20 C5  C 0 1 Y N N 39.689 -26.954 135.398 3.582  0.060  -1.238 C20 6GH 5  
6GH N01 N1  N 0 1 Y N N 39.145 -24.635 133.835 1.748  1.863  1.392  N01 6GH 6  
6GH C01 C6  C 0 1 Y N N 40.191 -24.772 134.677 1.965  1.014  0.386  C01 6GH 7  
6GH C02 C7  C 0 1 Y N N 40.824 -23.620 135.122 0.909  0.233  -0.080 C02 6GH 8  
6GH C03 C8  C 0 1 Y N N 40.381 -22.380 134.669 -0.336 0.373  0.528  C03 6GH 9  
6GH N02 N2  N 0 1 Y N N 39.341 -22.313 133.827 -0.476 1.241  1.527  N02 6GH 10 
6GH C04 C9  C 0 1 Y N N 38.725 -23.428 133.407 0.550  1.968  1.944  C04 6GH 11 
6GH N03 N3  N 0 1 N N N 37.692 -23.323 132.551 0.364  2.860  2.986  N03 6GH 12 
6GH N04 N4  N 0 1 N N N 40.939 -21.239 135.057 -1.416 -0.383 0.099  N04 6GH 13 
6GH C05 C10 C 0 1 N N N 42.078 -21.183 136.009 -1.229 -1.413 -0.926 C05 6GH 14 
6GH C06 C11 C 0 1 Y N N 43.291 -21.676 135.484 -0.896 -2.725 -0.263 C06 6GH 15 
6GH N05 N5  N 0 1 Y N N 43.702 -21.331 134.255 0.353  -2.994 0.060  N05 6GH 16 
6GH C07 C12 C 0 1 Y N N 44.913 -21.823 133.737 0.691  -4.129 0.641  C07 6GH 17 
6GH C08 C13 C 0 1 Y N N 45.702 -22.664 134.522 -0.264 -5.085 0.933  C08 6GH 18 
6GH C09 C14 C 0 1 Y N N 45.285 -23.018 135.797 -1.590 -4.835 0.612  C09 6GH 19 
6GH C11 C15 C 0 1 N N N 40.305 -19.936 134.729 -2.746 -0.151 0.670  C11 6GH 20 
6GH C12 C16 C 0 1 Y N N 40.670 -19.417 133.481 -3.469 0.888  -0.148 C12 6GH 21 
6GH C14 C17 C 0 1 Y N N 40.172 -17.934 131.632 -4.987 1.452  -1.903 C14 6GH 22 
6GH C16 C18 C 0 1 Y N N 42.178 -19.262 131.623 -3.885 3.111  -0.587 C16 6GH 23 
6GH N06 N6  N 0 1 Y N N 41.810 -19.785 132.876 -3.273 2.167  0.103  N06 6GH 24 
6GH C18 C19 C 0 1 Y N N 41.871 -26.345 135.296 4.401  1.661  0.200  C18 6GH 25 
6GH C19 C20 C 0 1 Y N N 42.061 -27.602 135.730 5.522  1.412  -0.474 C19 6GH 26 
6GH S01 S1  S 0 1 Y N N 40.541 -28.345 135.917 5.222  0.184  -1.695 S01 6GH 27 
6GH H1  H1  H 0 1 N N N 43.742 -22.779 137.267 -2.927 -3.407 -0.269 H1  6GH 28 
6GH H2  H2  H 0 1 N N N 38.930 -18.169 133.360 -4.486 -0.562 -1.354 H2  6GH 29 
6GH H3  H3  H 0 1 N N N 41.622 -17.913 130.045 -5.249 3.564  -2.174 H3  6GH 30 
6GH H4  H4  H 0 1 N N N 38.616 -26.865 135.320 2.864  -0.604 -1.697 H4  6GH 31 
6GH H5  H5  H 0 1 N N N 41.652 -23.685 135.813 1.052  -0.464 -0.892 H5  6GH 32 
6GH H6  H6  H 0 1 N N N 37.528 -22.359 132.342 -0.509 2.946  3.400  H6  6GH 33 
6GH H7  H7  H 0 1 N N N 37.907 -23.815 131.707 1.106  3.398  3.302  H7  6GH 34 
6GH H8  H8  H 0 1 N N N 42.230 -20.134 136.305 -2.145 -1.520 -1.505 H8  6GH 35 
6GH H9  H9  H 0 1 N N N 41.817 -21.780 136.895 -0.412 -1.123 -1.587 H9  6GH 36 
6GH H10 H10 H 0 1 N N N 45.229 -21.552 132.741 1.725  -4.314 0.891  H10 6GH 37 
6GH H11 H11 H 0 1 N N N 46.638 -23.040 134.137 0.018  -6.012 1.408  H11 6GH 38 
6GH H12 H12 H 0 1 N N N 45.887 -23.672 136.410 -2.357 -5.564 0.829  H12 6GH 39 
6GH H13 H13 H 0 1 N N N 40.592 -19.208 135.502 -3.313 -1.082 0.659  H13 6GH 40 
6GH H14 H14 H 0 1 N N N 39.213 -20.071 134.740 -2.644 0.201  1.696  H14 6GH 41 
6GH H15 H15 H 0 1 N N N 39.520 -17.212 131.163 -5.665 1.169  -2.694 H15 6GH 42 
6GH H16 H16 H 0 1 N N N 43.093 -19.582 131.146 -3.696 4.148  -0.355 H16 6GH 43 
6GH H17 H17 H 0 1 N N N 42.691 -25.666 135.113 4.342  2.383  1.001  H17 6GH 44 
6GH H18 H18 H 0 1 N N N 43.017 -28.064 135.927 6.473  1.893  -0.297 H18 6GH 45 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
6GH C15 C16 DOUB Y N 1  
6GH C15 C14 SING Y N 2  
6GH C16 N06 SING Y N 3  
6GH C14 C13 DOUB Y N 4  
6GH N03 C04 SING N N 5  
6GH C13 C12 SING Y N 6  
6GH N06 C12 DOUB Y N 7  
6GH C04 N02 DOUB Y N 8  
6GH C04 N01 SING Y N 9  
6GH C12 C11 SING N N 10 
6GH C07 N05 DOUB Y N 11 
6GH C07 C08 SING Y N 12 
6GH N02 C03 SING Y N 13 
6GH N01 C01 DOUB Y N 14 
6GH N05 C06 SING Y N 15 
6GH C08 C09 DOUB Y N 16 
6GH C03 N04 SING N N 17 
6GH C03 C02 DOUB Y N 18 
6GH C01 C17 SING N N 19 
6GH C01 C02 SING Y N 20 
6GH C11 N04 SING N N 21 
6GH N04 C05 SING N N 22 
6GH C17 C18 SING Y N 23 
6GH C17 C20 DOUB Y N 24 
6GH C18 C19 DOUB Y N 25 
6GH C20 S01 SING Y N 26 
6GH C06 C05 SING N N 27 
6GH C06 C10 DOUB Y N 28 
6GH C19 S01 SING Y N 29 
6GH C09 C10 SING Y N 30 
6GH C10 H1  SING N N 31 
6GH C13 H2  SING N N 32 
6GH C15 H3  SING N N 33 
6GH C20 H4  SING N N 34 
6GH C02 H5  SING N N 35 
6GH N03 H6  SING N N 36 
6GH N03 H7  SING N N 37 
6GH C05 H8  SING N N 38 
6GH C05 H9  SING N N 39 
6GH C07 H10 SING N N 40 
6GH C08 H11 SING N N 41 
6GH C09 H12 SING N N 42 
6GH C11 H13 SING N N 43 
6GH C11 H14 SING N N 44 
6GH C14 H15 SING N N 45 
6GH C16 H16 SING N N 46 
6GH C18 H17 SING N N 47 
6GH C19 H18 SING N N 48 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
6GH SMILES           ACDLabs              12.01 "c4c(CN(c2cc(c1ccsc1)nc(n2)N)Cc3ccccn3)nccc4"                                                                                             
6GH InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C20H18N6S/c21-20-24-18(15-7-10-27-14-15)11-19(25-20)26(12-16-5-1-3-8-22-16)13-17-6-2-4-9-23-17/h1-11,14H,12-13H2,(H2,21,24,25)" 
6GH InChIKey         InChI                1.03  GNKFSGIISAKKRV-UHFFFAOYSA-N                                                                                                               
6GH SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2cscc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                               
6GH SMILES           CACTVS               3.385 "Nc1nc(cc(n1)c2cscc2)N(Cc3ccccn3)Cc4ccccn4"                                                                                               
6GH SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccsc4"                                                                                             
6GH SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "c1ccnc(c1)CN(Cc2ccccn2)c3cc(nc(n3)N)c4ccsc4"                                                                                             
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
6GH "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "N~4~,N~4~-bis[(pyridin-2-yl)methyl]-6-(thiophen-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine" 
6GH "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "~{N}4,~{N}4-bis(pyridin-2-ylmethyl)-6-thiophen-3-yl-pyrimidine-2,4-diamine"  
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
6GH "Create component" 2016-04-06 RCSB 
6GH "Initial release"  2017-03-08 RCSB 
# 
