data_DHE
# 
_chem_comp.id                                    DHE 
_chem_comp.name                                  "HEME D" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C34 H32 Fe N4 O10" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     1999-07-08 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2023-09-23 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   Y 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        712.484 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     DHE 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   Y 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        1AOF 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
DHE FE   FE    FE 0 0 N N N -0.577 15.488 82.469 ? ? ? FE   DHE 1  
DHE CHA  CHA   C  0 1 N N N -3.326 13.900 81.157 ? ? ? CHA  DHE 2  
DHE CHB  CHB   C  0 1 N N N 1.013  15.266 79.468 ? ? ? CHB  DHE 3  
DHE CHC  CHC   C  0 1 N N N 1.915  17.417 83.674 ? ? ? CHC  DHE 4  
DHE CHD  CHD   C  0 1 N N N -1.860 15.101 85.625 ? ? ? CHD  DHE 5  
DHE NA   "N A" N  0 1 N N S -1.122 14.814 80.580 ? ? ? NA   DHE 6  
DHE C1A  C1A   C  0 1 N N N -2.292 14.142 80.266 ? ? ? C1A  DHE 7  
DHE C2A  C2A   C  0 1 N N N -2.218 13.745 78.907 ? ? ? C2A  DHE 8  
DHE C3A  C3A   C  0 1 N N N -0.982 14.115 78.429 ? ? ? C3A  DHE 9  
DHE C4A  C4A   C  0 1 N N N -0.282 14.761 79.491 ? ? ? C4A  DHE 10 
DHE CMA  CMA   C  0 1 N N N -0.402 13.894 77.066 ? ? ? CMA  DHE 11 
DHE CAA  CAA   C  0 1 N N N -3.304 13.003 78.180 ? ? ? CAA  DHE 12 
DHE CBA  CBA   C  0 1 N N N -3.257 11.572 78.462 ? ? ? CBA  DHE 13 
DHE CGA  CGA   C  0 1 N N N -4.184 10.686 77.759 ? ? ? CGA  DHE 14 
DHE O1A  O1A   O  0 1 N N N -4.921 11.146 76.874 ? ? ? O1A  DHE 15 
DHE O2A  O2A   O  0 1 N N N -4.194 9.494  78.076 ? ? ? O2A  DHE 16 
DHE NB   "N B" N  0 1 N N N 1.187  16.261 81.702 ? ? ? NB   DHE 17 
DHE C1B  C1B   C  0 1 N N N 1.592  16.076 80.409 ? ? ? C1B  DHE 18 
DHE C2B  C2B   C  0 1 N N N 2.790  16.916 80.145 ? ? ? C2B  DHE 19 
DHE OMB  OMB   O  0 1 N N N 3.507  16.893 79.168 ? ? ? OMB  DHE 20 
DHE C3B  C3B   C  0 1 N N R 2.948  17.832 81.355 ? ? ? C3B  DHE 21 
DHE CGB  CGB   C  0 1 N N N 2.353  19.263 80.930 ? ? ? CGB  DHE 22 
DHE CAB  CAB   C  0 1 N N N 4.351  17.990 81.821 ? ? ? CAB  DHE 23 
DHE CBB  CBB   C  0 1 N N N 5.082  16.750 82.119 ? ? ? CBB  DHE 24 
DHE O1B  O1B   O  0 1 N N N 6.309  16.818 82.327 ? ? ? O1B  DHE 25 
DHE O2B  O2B   O  0 1 N N N 4.462  15.668 82.156 ? ? ? O2B  DHE 26 
DHE C4B  C4B   C  0 1 N N N 1.988  17.158 82.324 ? ? ? C4B  DHE 27 
DHE NC   "N C" N  0 1 N N N -0.058 16.147 84.363 ? ? ? NC   DHE 28 
DHE C1C  C1C   C  0 1 N N N 1.013  16.968 84.597 ? ? ? C1C  DHE 29 
DHE C2C  C2C   C  0 1 N N N 1.073  17.313 86.036 ? ? ? C2C  DHE 30 
DHE OMC  OMC   O  0 1 N N N 1.903  17.996 86.588 ? ? ? OMC  DHE 31 
DHE C3C  C3C   C  0 1 N N R -0.117 16.662 86.704 ? ? ? C3C  DHE 32 
DHE CGC  CGC   C  0 1 N N N -1.095 17.865 87.153 ? ? ? CGC  DHE 33 
DHE CAC  CAC   C  0 1 N N N 0.263  15.841 87.881 ? ? ? CAC  DHE 34 
DHE CBC  CBC   C  0 1 N N N 1.076  14.645 87.588 ? ? ? CBC  DHE 35 
DHE O1C  O1C   O  0 1 N N N 0.733  13.551 88.079 ? ? ? O1C  DHE 36 
DHE O2C  O2C   O  0 1 N N N 2.085  14.759 86.872 ? ? ? O2C  DHE 37 
DHE C4C  C4C   C  0 1 N N N -0.737 15.906 85.526 ? ? ? C4C  DHE 38 
DHE ND   "N D" N  0 1 Y N N -2.324 14.659 83.251 ? ? ? ND   DHE 39 
DHE C1D  C1D   C  0 1 Y N N -2.662 14.622 84.584 ? ? ? C1D  DHE 40 
DHE C2D  C2D   C  0 1 Y N N -3.968 14.031 84.688 ? ? ? C2D  DHE 41 
DHE C3D  C3D   C  0 1 Y N N -4.403 13.762 83.412 ? ? ? C3D  DHE 42 
DHE C4D  C4D   C  0 1 Y N N -3.354 14.093 82.517 ? ? ? C4D  DHE 43 
DHE CMD  CMD   C  0 1 N N N -4.671 13.799 85.996 ? ? ? CMD  DHE 44 
DHE CAD  CAD   C  0 1 N N N -5.699 13.225 82.983 ? ? ? CAD  DHE 45 
DHE CBD  CBD   C  0 1 N N N -6.848 13.579 83.416 ? ? ? CBD  DHE 46 
DHE CGD  CGD   C  0 1 N N N -8.123 13.052 82.945 ? ? ? CGD  DHE 47 
DHE O1D  O1D   O  0 1 N N N -9.125 13.193 83.665 ? ? ? O1D  DHE 48 
DHE O2D  O2D   O  0 1 N N N -8.156 12.477 81.841 ? ? ? O2D  DHE 49 
DHE HHA  HHA   H  0 1 N N N -4.233 13.506 80.723 ? ? ? HHA  DHE 50 
DHE HHB  HHB   H  0 1 N N N 1.625  14.992 78.622 ? ? ? HHB  DHE 51 
DHE HHC  HHC   H  0 1 N N N 2.683  18.071 84.060 ? ? ? HHC  DHE 52 
DHE HHD  HHD   H  0 1 N N N -2.150 14.809 86.623 ? ? ? HHD  DHE 53 
DHE HMA1 HMA1  H  0 0 N N N 0.612  14.319 77.025 ? ? ? HMA1 DHE 54 
DHE HMA2 HMA2  H  0 0 N N N -0.356 12.815 76.858 ? ? ? HMA2 DHE 55 
DHE HMA3 HMA3  H  0 0 N N N -1.036 14.386 76.314 ? ? ? HMA3 DHE 56 
DHE HAA1 HAA1  H  0 0 N N N -4.280 13.398 78.497 ? ? ? HAA1 DHE 57 
DHE HAA2 HAA2  H  0 0 N N N -3.180 13.158 77.098 ? ? ? HAA2 DHE 58 
DHE HBA1 HBA1  H  0 0 N N N -2.239 11.229 78.225 ? ? ? HBA1 DHE 59 
DHE HBA2 HBA2  H  0 0 N N N -3.445 11.448 79.539 ? ? ? HBA2 DHE 60 
DHE H2A  H2A   H  0 1 N N N -4.832 9.030  77.546 ? ? ? H2A  DHE 61 
DHE HGB1 HGB1  H  0 0 N N N 2.444  19.964 81.773 ? ? ? HGB1 DHE 62 
DHE HGB2 HGB2  H  0 0 N N N 2.915  19.652 80.068 ? ? ? HGB2 DHE 63 
DHE HGB3 HGB3  H  0 0 N N N 1.293  19.153 80.658 ? ? ? HGB3 DHE 64 
DHE HAB1 HAB1  H  0 0 N N N 4.906  18.526 81.037 ? ? ? HAB1 DHE 65 
DHE HAB2 HAB2  H  0 0 N N N 4.333  18.597 82.738 ? ? ? HAB2 DHE 66 
DHE H2B  H2B   H  0 1 N N N 5.066  14.963 82.359 ? ? ? H2B  DHE 67 
DHE HGC1 HGC1  H  0 0 N N N -1.985 17.449 87.648 ? ? ? HGC1 DHE 68 
DHE HGC2 HGC2  H  0 0 N N N -0.563 18.529 87.851 ? ? ? HGC2 DHE 69 
DHE HGC3 HGC3  H  0 0 N N N -1.403 18.437 86.266 ? ? ? HGC3 DHE 70 
DHE HAC1 HAC1  H  0 0 N N N 0.837  16.480 88.569 ? ? ? HAC1 DHE 71 
DHE HAC2 HAC2  H  0 0 N N N -0.662 15.509 88.375 ? ? ? HAC2 DHE 72 
DHE H2C  H2C   H  0 1 N N N 2.507  13.913 86.782 ? ? ? H2C  DHE 73 
DHE HMD1 HMD1  H  0 0 N N N -5.268 14.686 86.254 ? ? ? HMD1 DHE 74 
DHE HMD2 HMD2  H  0 0 N N N -5.333 12.925 85.906 ? ? ? HMD2 DHE 75 
DHE HMD3 HMD3  H  0 0 N N N -3.927 13.616 86.785 ? ? ? HMD3 DHE 76 
DHE HAD1 HAD1  H  0 0 N N N -5.736 13.400 81.898 ? ? ? HAD1 DHE 77 
DHE HAD2 HAD2  H  0 0 N N N -5.640 12.144 83.179 ? ? ? HAD2 DHE 78 
DHE HBD1 HBD1  H  0 0 N N N -6.829 13.375 84.497 ? ? ? HBD1 DHE 79 
DHE HBD2 HBD2  H  0 0 N N N -6.901 14.665 83.249 ? ? ? HBD2 DHE 80 
DHE H2D  H2D   H  0 1 N N N -9.042 12.183 81.663 ? ? ? H2D  DHE 81 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
DHE FE  NA   SING N N 1  
DHE FE  NB   SING N N 2  
DHE FE  NC   SING N N 3  
DHE FE  ND   SING N N 4  
DHE CHA C1A  DOUB N N 5  
DHE CHA C4D  SING N N 6  
DHE CHA HHA  SING N N 7  
DHE CHB C4A  DOUB N N 8  
DHE CHB C1B  SING N N 9  
DHE CHB HHB  SING N N 10 
DHE CHC C4B  DOUB N N 11 
DHE CHC C1C  SING N N 12 
DHE CHC HHC  SING N N 13 
DHE CHD C4C  DOUB N N 14 
DHE CHD C1D  SING N N 15 
DHE CHD HHD  SING N N 16 
DHE NA  C1A  SING N N 17 
DHE NA  C4A  SING N N 18 
DHE C1A C2A  SING N N 19 
DHE C2A C3A  DOUB N N 20 
DHE C2A CAA  SING N N 21 
DHE C3A C4A  SING N N 22 
DHE C3A CMA  SING N N 23 
DHE CMA HMA1 SING N N 24 
DHE CMA HMA2 SING N N 25 
DHE CMA HMA3 SING N N 26 
DHE CAA CBA  SING N N 27 
DHE CAA HAA1 SING N N 28 
DHE CAA HAA2 SING N N 29 
DHE CBA CGA  SING N N 30 
DHE CBA HBA1 SING N N 31 
DHE CBA HBA2 SING N N 32 
DHE CGA O1A  DOUB N N 33 
DHE CGA O2A  SING N N 34 
DHE O2A H2A  SING N N 35 
DHE NB  C1B  DOUB N N 36 
DHE NB  C4B  SING N N 37 
DHE C1B C2B  SING N N 38 
DHE C2B OMB  DOUB N N 39 
DHE C2B C3B  SING N N 40 
DHE C3B CGB  SING N N 41 
DHE C3B CAB  SING N N 42 
DHE C3B C4B  SING N N 43 
DHE CGB HGB1 SING N N 44 
DHE CGB HGB2 SING N N 45 
DHE CGB HGB3 SING N N 46 
DHE CAB CBB  SING N N 47 
DHE CAB HAB1 SING N N 48 
DHE CAB HAB2 SING N N 49 
DHE CBB O1B  DOUB N N 50 
DHE CBB O2B  SING N N 51 
DHE O2B H2B  SING N N 52 
DHE NC  C1C  DOUB N N 53 
DHE NC  C4C  SING N N 54 
DHE C1C C2C  SING N N 55 
DHE C2C OMC  DOUB N N 56 
DHE C2C C3C  SING N N 57 
DHE C3C CGC  SING N N 58 
DHE C3C CAC  SING N N 59 
DHE C3C C4C  SING N N 60 
DHE CGC HGC1 SING N N 61 
DHE CGC HGC2 SING N N 62 
DHE CGC HGC3 SING N N 63 
DHE CAC CBC  SING N N 64 
DHE CAC HAC1 SING N N 65 
DHE CAC HAC2 SING N N 66 
DHE CBC O1C  DOUB N N 67 
DHE CBC O2C  SING N N 68 
DHE O2C H2C  SING N N 69 
DHE ND  C1D  SING Y N 70 
DHE ND  C4D  SING Y N 71 
DHE C1D C2D  DOUB Y N 72 
DHE C2D C3D  SING Y N 73 
DHE C2D CMD  SING N N 74 
DHE C3D C4D  DOUB Y N 75 
DHE C3D CAD  SING N N 76 
DHE CMD HMD1 SING N N 77 
DHE CMD HMD2 SING N N 78 
DHE CMD HMD3 SING N N 79 
DHE CAD CBD  SING N N 80 
DHE CAD HAD1 SING N N 81 
DHE CAD HAD2 SING N N 82 
DHE CBD CGD  SING N N 83 
DHE CBD HBD1 SING N N 84 
DHE CBD HBD2 SING N N 85 
DHE CGD O1D  DOUB N N 86 
DHE CGD O2D  SING N N 87 
DHE O2D H2D  SING N N 88 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
DHE InChI            InChI                1.06  "InChI=1S/C34H34N4O10.Fe/c1-15-17(5-7-27(39)40)21-10-22-18(6-8-28(41)42)16(2)20(36-22)11-25-33(3,13-29(43)44)32(48)24(38-25)12-26-34(4,14-30(45)46)31(47)23(37-26)9-19(15)35-21;/h9-12H,5-8,13-14H2,1-4H3,(H6,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48);/q;+2/p-2/t33-,34-;/m1./s1" 
DHE InChIKey         InChI                1.06  XLQCGNUTSJTZNF-YDXXJHAFSA-L                                                                                                                                                                                                                                                          
DHE SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "CC1=C(CCC(O)=O)C2=Cc3n4[Fe][N@]2C1=CC5=NC(=CC6=NC(=Cc4c(C)c3CCC(O)=O)[C@@](C)(CC(O)=O)C6=O)[C@@](C)(CC(O)=O)C5=O"                                                                                                                                                                   
DHE SMILES           CACTVS               3.385 "CC1=C(CCC(O)=O)C2=Cc3n4[Fe][N]2C1=CC5=NC(=CC6=NC(=Cc4c(C)c3CCC(O)=O)[C](C)(CC(O)=O)C6=O)[C](C)(CC(O)=O)C5=O"                                                                                                                                                                        
DHE SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "Cc1c2n3c(c1CCC(=O)O)C=C4C(=C(C5=CC6=[N]7[Fe]3(N45)[N]8=C(C=C7[C@@](C6=O)(C)CC(=O)O)C(=O)[C@](C8=C2)(C)CC(=O)O)C)CCC(=O)O"                                                                                                                                                           
DHE SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "Cc1c2n3c(c1CCC(=O)O)C=C4C(=C(C5=CC6=[N]7[Fe]3(N45)[N]8=C(C=C7C(C6=O)(C)CC(=O)O)C(=O)C(C8=C2)(C)CC(=O)O)C)CCC(=O)O"                                                                                                                                                                  
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
DHE "Create component"  1999-07-08 RCSB 
DHE "Modify descriptor" 2023-09-23 RCSB 
# 
