data_IJD
# 
_chem_comp.id                                    IJD 
_chem_comp.name                                  "6-cyclopropyl-N-{1-[2-(dimethylamino)ethyl]-3-(pyridin-2-yl)-1H-pyrazol-5-yl}-3-[(pyrimidin-5-yl)amino]pyridine-2-carboxamide" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C25 H27 N9 O" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2022-01-26 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2022-10-07 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        469.542 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     IJD 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5SF4 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
IJD C10 C1  C 0 1 Y N N 14.844 35.520 -15.179 3.007  -1.678 0.667  C10 IJD 1  
IJD C11 C2  C 0 1 Y N N 15.971 38.070 -15.037 4.394  0.671  0.573  C11 IJD 2  
IJD C15 C3  C 0 1 N N N 18.093 39.663 -15.058 6.634  1.943  0.901  C15 IJD 3  
IJD C16 C4  C 0 1 N N N 10.685 39.754 -12.304 -1.355 3.384  0.223  C16 IJD 4  
IJD C17 C5  C 0 1 Y N N 9.512  36.195 -9.031  -4.528 -0.461 0.653  C17 IJD 5  
IJD C22 C6  C 0 1 Y N N 15.894 35.865 -16.028 4.402  -1.720 0.664  C22 IJD 6  
IJD C23 C7  C 0 1 Y N N 14.744 33.170 -15.964 1.696  -3.366 -0.455 C23 IJD 7  
IJD C24 C8  C 0 1 Y N N 16.476 37.140 -15.941 5.096  -0.526 0.616  C24 IJD 8  
IJD C25 C9  C 0 1 Y N N 15.672 31.100 -17.402 0.616  -4.357 -2.694 C25 IJD 9  
IJD C26 C10 C 0 1 N N N 11.814 40.722 -11.830 -1.180 3.707  -1.262 C26 IJD 10 
IJD C28 C11 C 0 1 Y N N 13.922 32.048 -16.239 0.849  -4.470 -0.411 C28 IJD 11 
IJD C1  C12 C 0 1 Y N N 11.538 37.324 -11.892 -1.119 0.892  0.486  C1  IJD 12 
IJD C2  C13 C 0 1 Y N N 14.367 36.507 -14.286 2.368  -0.432 0.617  C2  IJD 13 
IJD N3  N1  N 0 1 Y N N 9.832  38.029 -10.626 -3.219 1.649  0.413  N3  IJD 14 
IJD C4  C14 C 0 1 Y N N 11.278 36.377 -10.939 -1.971 -0.160 0.606  C4  IJD 15 
IJD N5  N2  N 0 1 Y N N 10.662 38.391 -11.688 -1.869 2.020  0.369  N5  IJD 16 
IJD C6  C15 C 0 1 Y N N 10.155 36.833 -10.202 -3.284 0.343  0.560  C6  IJD 17 
IJD N7  N3  N 0 1 Y N N 14.949 37.724 -14.255 3.081  0.688  0.572  N7  IJD 18 
IJD C8  C16 C 0 1 N N N 13.219 36.235 -13.376 0.892  -0.363 0.614  C8  IJD 19 
IJD N9  N4  N 0 1 N N N 12.606 37.296 -12.820 0.273  0.827  0.489  N9  IJD 20 
IJD C12 C17 C 0 1 N N N 16.564 39.470 -14.970 5.153  1.972  0.521  C12 IJD 21 
IJD N13 N5  N 0 1 N N N 14.262 34.255 -15.210 2.265  -2.852 0.714  N13 IJD 22 
IJD C14 C18 C 0 1 N N N 17.362 39.907 -13.735 5.615  2.574  1.851  C14 IJD 23 
IJD O18 O1  O 0 1 N N N 12.791 35.118 -13.202 0.236  -1.381 0.723  O18 IJD 24 
IJD N19 N6  N 0 1 Y N N 9.875  34.978 -8.640  -4.451 -1.777 0.807  N19 IJD 25 
IJD N20 N7  N 0 1 Y N N 14.425 31.035 -16.944 0.335  -4.930 -1.540 N20 IJD 26 
IJD N21 N8  N 0 1 Y N N 16.466 32.143 -17.178 1.413  -3.311 -2.777 N21 IJD 27 
IJD N27 N9  N 0 1 N N N 13.109 40.442 -12.518 -0.665 5.075  -1.409 N27 IJD 28 
IJD C29 C19 C 0 1 Y N N 16.051 33.178 -16.466 1.966  -2.791 -1.694 C29 IJD 29 
IJD C30 C20 C 0 1 Y N N 9.398  34.387 -7.544  -5.530 -2.526 0.899  C30 IJD 30 
IJD C31 C21 C 0 1 Y N N 8.620  36.960 -8.267  -5.767 0.172  0.583  C31 IJD 31 
IJD C32 C22 C 0 1 N N N 13.041 40.760 -13.954 -0.261 5.339  -2.796 C32 IJD 32 
IJD C33 C23 C 0 1 N N N 14.271 41.133 -11.936 -1.652 6.061  -0.950 C33 IJD 33 
IJD C34 C24 C 0 1 Y N N 8.476  35.063 -6.757  -6.792 -1.963 0.837  C34 IJD 34 
IJD C35 C25 C 0 1 Y N N 8.090  36.372 -7.124  -6.918 -0.591 0.677  C35 IJD 35 
IJD H1  H1  H 0 1 N N N 18.752 38.790 -15.170 7.061  0.982  1.187  H1  IJD 36 
IJD H2  H2  H 0 1 N N N 18.509 40.511 -15.621 7.305  2.614  0.364  H2  IJD 37 
IJD H3  H3  H 0 1 N N N 10.791 39.626 -13.391 -0.393 3.466  0.728  H3  IJD 38 
IJD H4  H4  H 0 1 N N N 9.720  40.235 -12.084 -2.059 4.087  0.667  H4  IJD 39 
IJD H5  H5  H 0 1 N N N 16.260 35.152 -16.752 4.926  -2.664 0.698  H5  IJD 40 
IJD H6  H6  H 0 1 N N N 17.313 37.398 -16.573 6.176  -0.524 0.611  H6  IJD 41 
IJD H7  H7  H 0 1 N N N 16.055 30.272 -17.979 0.180  -4.757 -3.597 H7  IJD 42 
IJD H8  H8  H 0 1 N N N 11.511 41.757 -12.049 -0.476 3.004  -1.707 H8  IJD 43 
IJD H9  H9  H 0 1 N N N 11.954 40.602 -10.746 -2.143 3.625  -1.768 H9  IJD 44 
IJD H10 H10 H 0 1 N N N 12.903 32.015 -15.882 0.615  -4.945 0.530  H10 IJD 45 
IJD H11 H11 H 0 1 N N N 11.823 35.459 -10.779 -1.689 -1.197 0.716  H11 IJD 46 
IJD H12 H12 H 0 1 N N N 12.954 38.190 -13.102 0.797  1.640  0.402  H12 IJD 47 
IJD H13 H13 H 0 1 N N N 15.966 40.261 -15.446 4.848  2.663  -0.265 H13 IJD 48 
IJD H14 H14 H 0 1 N N N 13.442 34.108 -14.656 2.141  -3.314 1.558  H14 IJD 49 
IJD H15 H15 H 0 1 N N N 17.256 40.931 -13.347 5.371  2.029  2.762  H15 IJD 50 
IJD H16 H16 H 0 1 N N N 17.499 39.210 -12.896 5.614  3.661  1.938  H16 IJD 51 
IJD H18 H18 H 0 1 N N N 16.708 34.014 -16.276 2.618  -1.933 -1.770 H18 IJD 52 
IJD H19 H19 H 0 1 N N N 9.725  33.394 -7.272  -5.429 -3.594 1.023  H19 IJD 53 
IJD H20 H20 H 0 1 N N N 8.355  37.967 -8.555  -5.828 1.243  0.458  H20 IJD 54 
IJD H21 H21 H 0 1 N N N 14.011 40.541 -14.425 -1.121 5.218  -3.454 H21 IJD 55 
IJD H22 H22 H 0 1 N N N 12.258 40.150 -14.428 0.116  6.359  -2.876 H22 IJD 56 
IJD H23 H23 H 0 1 N N N 12.803 41.826 -14.082 0.521  4.638  -3.087 H23 IJD 57 
IJD H24 H24 H 0 1 N N N 15.176 40.870 -12.503 -1.882 5.885  0.101  H24 IJD 58 
IJD H25 H25 H 0 1 N N N 14.112 42.220 -11.983 -1.245 7.065  -1.070 H25 IJD 59 
IJD H26 H26 H 0 1 N N N 14.393 40.825 -10.887 -2.563 5.965  -1.542 H26 IJD 60 
IJD H27 H27 H 0 1 N N N 8.060  34.595 -5.877  -7.671 -2.586 0.913  H27 IJD 61 
IJD H28 H28 H 0 1 N N N 7.383  36.916 -6.516  -7.892 -0.128 0.627  H28 IJD 62 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
IJD C1  N5  SING Y N 1  
IJD C1  N9  SING N N 2  
IJD C1  C4  DOUB Y N 3  
IJD C2  C8  SING N N 4  
IJD C2  N7  DOUB Y N 5  
IJD C2  C10 SING Y N 6  
IJD N3  N5  SING Y N 7  
IJD N3  C6  DOUB Y N 8  
IJD C4  C6  SING Y N 9  
IJD N5  C16 SING N N 10 
IJD C6  C17 SING N N 11 
IJD N7  C11 SING Y N 12 
IJD C8  O18 DOUB N N 13 
IJD C8  N9  SING N N 14 
IJD C10 N13 SING N N 15 
IJD C10 C22 DOUB Y N 16 
IJD C11 C12 SING N N 17 
IJD C11 C24 DOUB Y N 18 
IJD C12 C14 SING N N 19 
IJD C12 C15 SING N N 20 
IJD N13 C23 SING N N 21 
IJD C14 C15 SING N N 22 
IJD C16 C26 SING N N 23 
IJD C17 C31 DOUB Y N 24 
IJD C17 N19 SING Y N 25 
IJD N19 C30 DOUB Y N 26 
IJD N20 C25 DOUB Y N 27 
IJD N20 C28 SING Y N 28 
IJD N21 C29 DOUB Y N 29 
IJD N21 C25 SING Y N 30 
IJD C22 C24 SING Y N 31 
IJD C23 C28 DOUB Y N 32 
IJD C23 C29 SING Y N 33 
IJD C26 N27 SING N N 34 
IJD N27 C32 SING N N 35 
IJD N27 C33 SING N N 36 
IJD C30 C34 SING Y N 37 
IJD C31 C35 SING Y N 38 
IJD C34 C35 DOUB Y N 39 
IJD C15 H1  SING N N 40 
IJD C15 H2  SING N N 41 
IJD C16 H3  SING N N 42 
IJD C16 H4  SING N N 43 
IJD C22 H5  SING N N 44 
IJD C24 H6  SING N N 45 
IJD C25 H7  SING N N 46 
IJD C26 H8  SING N N 47 
IJD C26 H9  SING N N 48 
IJD C28 H10 SING N N 49 
IJD C4  H11 SING N N 50 
IJD N9  H12 SING N N 51 
IJD C12 H13 SING N N 52 
IJD N13 H14 SING N N 53 
IJD C14 H15 SING N N 54 
IJD C14 H16 SING N N 55 
IJD C29 H18 SING N N 56 
IJD C30 H19 SING N N 57 
IJD C31 H20 SING N N 58 
IJD C32 H21 SING N N 59 
IJD C32 H22 SING N N 60 
IJD C32 H23 SING N N 61 
IJD C33 H24 SING N N 62 
IJD C33 H25 SING N N 63 
IJD C33 H26 SING N N 64 
IJD C34 H27 SING N N 65 
IJD C35 H28 SING N N 66 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
IJD SMILES           ACDLabs              12.01 "CN(C)CCn1nc(cc1NC(=O)c1nc(ccc1Nc1cncnc1)C1CC1)c1ccccn1"                                                                                                                             
IJD InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C25H27N9O/c1-33(2)11-12-34-23(13-22(32-34)20-5-3-4-10-28-20)31-25(35)24-21(29-18-14-26-16-27-15-18)9-8-19(30-24)17-6-7-17/h3-5,8-10,13-17,29H,6-7,11-12H2,1-2H3,(H,31,35)" 
IJD InChIKey         InChI                1.03  YQBHCXNSRTWRPM-UHFFFAOYSA-N                                                                                                                                                          
IJD SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "CN(C)CCn1nc(cc1NC(=O)c2nc(ccc2Nc3cncnc3)C4CC4)c5ccccn5"                                                                                                                             
IJD SMILES           CACTVS               3.385 "CN(C)CCn1nc(cc1NC(=O)c2nc(ccc2Nc3cncnc3)C4CC4)c5ccccn5"                                                                                                                             
IJD SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CN(C)CCn1c(cc(n1)c2ccccn2)NC(=O)c3c(ccc(n3)C4CC4)Nc5cncnc5"                                                                                                                         
IJD SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CN(C)CCn1c(cc(n1)c2ccccn2)NC(=O)c3c(ccc(n3)C4CC4)Nc5cncnc5"                                                                                                                         
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
IJD "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "6-cyclopropyl-N-{1-[2-(dimethylamino)ethyl]-3-(pyridin-2-yl)-1H-pyrazol-5-yl}-3-[(pyrimidin-5-yl)amino]pyridine-2-carboxamide" 
IJD "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "6-cyclopropyl-~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyl]-5-pyridin-2-yl-pyrazol-3-yl]-3-(pyrimidin-5-ylamino)pyridine-2-carboxamide"     
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
IJD "Create component" 2022-01-26 RCSB 
IJD "Initial release"  2022-10-12 RCSB 
# 
