data_9AA
# 
_chem_comp.id                                    9AA 
_chem_comp.name                                  "(5S)-5-[(2,4-dimethoxyphenyl)methyl]-5-hydroxy-2-sulfanylideneimidazolidin-4-one" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C12 H14 N2 O4 S" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2017-04-13 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2017-08-25 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        282.316 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     9AA 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5VGY 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
9AA C5  C1  C 0 1 Y N N 1.189  4.992  83.593 -1.199 -1.076 -1.013 C5  9AA 1  
9AA C4  C2  C 0 1 Y N N 1.491  6.352  83.704 -2.440 -1.555 -0.640 C4  9AA 2  
9AA C8  C3  C 0 1 Y N N -0.657 6.796  84.608 -3.006 0.601  0.254  C8  9AA 3  
9AA C6  C4  C 0 1 Y N N -0.058 4.564  83.986 -0.857 0.238  -0.755 C6  9AA 4  
9AA C3  C5  C 0 1 Y N N 0.581  7.227  84.200 -3.347 -0.718 -0.006 C3  9AA 5  
9AA C7  C6  C 0 1 Y N N -0.997 5.485  84.465 -1.760 1.079  -0.121 C7  9AA 6  
9AA C13 C7  C 0 1 N N N -0.879 0.899  84.799 2.833  1.174  -0.362 C13 9AA 7  
9AA C16 C8  C 0 1 N N N -2.297 1.700  86.268 3.024  -0.965 0.208  C16 9AA 8  
9AA C12 C9  C 0 1 N N S -0.446 2.265  85.071 1.460  0.658  0.022  C12 9AA 9  
9AA C1  C10 C 0 1 N N N 2.089  9.122  84.277 -4.850 -2.558 0.061  C1  9AA 10 
9AA C10 C11 C 0 1 N N N -3.173 5.852  85.304 -2.402 3.180  0.789  C10 9AA 11 
9AA C11 C12 C 0 1 N N N -0.422 3.090  83.846 0.497  0.757  -1.163 C11 9AA 12 
9AA N15 N1  N 0 1 N N N -2.003 0.555  85.540 3.670  0.129  -0.212 N15 9AA 13 
9AA N18 N2  N 0 1 N N N -1.211 2.580  86.155 1.707  -0.751 0.375  N18 9AA 14 
9AA O14 O1  O 0 1 N N N -0.404 0.091  83.990 3.117  2.294  -0.731 O14 9AA 15 
9AA O19 O2  O 0 1 N N N 0.898  2.244  85.659 0.948  1.376  1.145  O19 9AA 16 
9AA O2  O3  O 0 1 N N N 0.759  8.598  84.430 -4.568 -1.189 0.360  O2  9AA 17 
9AA O9  O4  O 0 1 N N N -2.196 4.935  84.825 -1.423 2.371  0.132  O9  9AA 18 
9AA S17 S1  S 0 1 N N N -3.724 2.014  87.059 3.789  -2.469 0.498  S17 9AA 19 
9AA H1  H1  H 0 1 N N N 1.917  4.294  83.208 -0.493 -1.731 -1.502 H1  9AA 20 
9AA H2  H2  H 0 1 N N N 2.461  6.711  83.391 -2.704 -2.583 -0.842 H2  9AA 21 
9AA H3  H3  H 0 1 N N N -1.359 7.494  85.041 -3.711 1.254  0.747  H3  9AA 22 
9AA H4  H4  H 0 1 N N N 2.084  10.202 84.486 -5.855 -2.805 0.405  H4  9AA 23 
9AA H5  H5  H 0 1 N N N 2.766  8.615  84.981 -4.786 -2.715 -1.016 H5  9AA 24 
9AA H6  H6  H 0 1 N N N 2.435  8.949  83.247 -4.126 -3.197 0.566  H6  9AA 25 
9AA H7  H7  H 0 1 N N N -4.092 5.307  85.563 -2.006 4.186  0.930  H7  9AA 26 
9AA H8  H8  H 0 1 N N N -2.787 6.365  86.197 -3.303 3.227  0.178  H8  9AA 27 
9AA H9  H9  H 0 1 N N N -3.395 6.593  84.522 -2.642 2.744  1.758  H9  9AA 28 
9AA H10 H10 H 0 1 N N N -1.426 3.041  83.399 0.879  0.163  -1.993 H10 9AA 29 
9AA H11 H11 H 0 1 N N N 0.308  2.636  83.160 0.409  1.799  -1.473 H11 9AA 30 
9AA H12 H12 H 0 1 N N N -2.490 -0.319 85.547 4.624  0.165  -0.388 H12 9AA 31 
9AA H13 H13 H 0 1 N N N -1.023 3.335  86.783 1.048  -1.398 0.671  H13 9AA 32 
9AA H14 H14 H 0 1 N N N 0.891  1.715  86.448 1.503  1.319  1.935  H14 9AA 33 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
9AA C5  C4  DOUB Y N 1  
9AA C5  C6  SING Y N 2  
9AA C4  C3  SING Y N 3  
9AA C11 C6  SING N N 4  
9AA C11 C12 SING N N 5  
9AA C6  C7  DOUB Y N 6  
9AA O14 C13 DOUB N N 7  
9AA C3  O2  SING N N 8  
9AA C3  C8  DOUB Y N 9  
9AA C1  O2  SING N N 10 
9AA C7  C8  SING Y N 11 
9AA C7  O9  SING N N 12 
9AA C13 C12 SING N N 13 
9AA C13 N15 SING N N 14 
9AA O9  C10 SING N N 15 
9AA C12 O19 SING N N 16 
9AA C12 N18 SING N N 17 
9AA N15 C16 SING N N 18 
9AA N18 C16 SING N N 19 
9AA C16 S17 DOUB N N 20 
9AA C5  H1  SING N N 21 
9AA C4  H2  SING N N 22 
9AA C8  H3  SING N N 23 
9AA C1  H4  SING N N 24 
9AA C1  H5  SING N N 25 
9AA C1  H6  SING N N 26 
9AA C10 H7  SING N N 27 
9AA C10 H8  SING N N 28 
9AA C10 H9  SING N N 29 
9AA C11 H10 SING N N 30 
9AA C11 H11 SING N N 31 
9AA N15 H12 SING N N 32 
9AA N18 H13 SING N N 33 
9AA O19 H14 SING N N 34 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
9AA SMILES           ACDLabs              12.01 "c1cc(cc(c1CC2(C(NC(=S)N2)=O)O)OC)OC"                                                                                       
9AA InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C12H14N2O4S/c1-17-8-4-3-7(9(5-8)18-2)6-12(16)10(15)13-11(19)14-12/h3-5,16H,6H2,1-2H3,(H2,13,14,15,19)/t12-/m0/s1" 
9AA InChIKey         InChI                1.03  HCADMEQVRWTPEA-LBPRGKRZSA-N                                                                                                 
9AA SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "COc1ccc(C[C@@]2(O)NC(=S)NC2=O)c(OC)c1"                                                                                     
9AA SMILES           CACTVS               3.385 "COc1ccc(C[C]2(O)NC(=S)NC2=O)c(OC)c1"                                                                                       
9AA SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "COc1ccc(c(c1)OC)C[C@@]2(C(=O)NC(=S)N2)O"                                                                                   
9AA SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "COc1ccc(c(c1)OC)CC2(C(=O)NC(=S)N2)O"                                                                                       
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
9AA "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "(5S)-5-[(2,4-dimethoxyphenyl)methyl]-5-hydroxy-2-sulfanylideneimidazolidin-4-one"      
9AA "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "(5~{S})-5-[(2,4-dimethoxyphenyl)methyl]-5-oxidanyl-2-sulfanylidene-imidazolidin-4-one" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
9AA "Create component" 2017-04-13 RCSB 
9AA "Initial release"  2017-08-30 RCSB 
# 
