data_Q16
# 
_chem_comp.id                                    Q16 
_chem_comp.name                                  "6-((((3S, 5R)-5-(((6-amino-4-methylpyridin-2-yl)methoxy)methyl)pyrrolidin-3-yl)oxy)methyl)-4-methylpyridin-2-amine" 
_chem_comp.type                                  non-polymer 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C19 H27 N5 O2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2013-08-22 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2014-09-05 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        357.450 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     Q16 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        4C39 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  EBI 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
Q16 N22    N22    N 0 1 N N N 15.906 10.317 54.930 -8.714 -0.086 1.106  N22    Q16 1  
Q16 C22    C22    C 0 1 Y N N 17.192 9.860  54.820 -7.495 0.173  0.490  C22    Q16 2  
Q16 C23    C23    C 0 1 Y N N 18.236 10.757 54.533 -7.419 1.137  -0.510 C23    Q16 3  
Q16 C24    C24    C 0 1 Y N N 19.566 10.294 54.425 -6.199 1.385  -1.114 C24    Q16 4  
Q16 C27    C27    C 0 1 N N N 20.694 11.253 54.123 -6.075 2.420  -2.202 C27    Q16 5  
Q16 C25    C25    C 0 1 Y N N 19.857 8.934  54.603 -5.093 0.658  -0.696 C25    Q16 6  
Q16 N21    N21    N 0 1 Y N N 17.497 8.538  54.970 -6.415 -0.495 0.866  N21    Q16 7  
Q16 C26    C26    C 0 1 Y N N 18.793 8.074  54.871 -5.240 -0.283 0.304  C26    Q16 8  
Q16 C12    C12    C 0 1 N N N 19.104 6.616  55.031 -4.043 -1.075 0.762  C12    Q16 9  
Q16 O11    O11    O 0 1 N N N 18.300 6.121  56.100 -2.891 -0.671 0.019  O11    Q16 10 
Q16 "C2'"  "C2'"  C 0 1 N N R 16.148 4.425  57.513 0.541  -0.660 -0.336 "C2'"  Q16 11 
Q16 "C5'"  "C5'"  C 0 1 N N N 17.079 4.287  55.271 -0.939 -0.594 1.482  "C5'"  Q16 12 
Q16 "N1'"  "N1'"  N 0 1 N N N 15.894 4.553  56.092 0.497  -0.769 1.145  "N1'"  Q16 13 
Q16 "C3'"  "C3'"  C 0 1 N N N 17.659 4.388  57.582 -0.721 -1.407 -0.818 "C3'"  Q16 14 
Q16 C10    C10    C 0 1 N N N 15.618 3.062  57.934 1.801  -1.332 -0.883 C10    Q16 15 
Q16 "C4'"  "C4'"  C 0 1 N N S 18.206 4.701  56.185 -1.694 -1.364 0.378  "C4'"  Q16 16 
Q16 O09    O09    O 0 1 N N N 14.211 3.014  57.692 2.954  -0.603 -0.456 O09    Q16 17 
Q16 C08    C08    C 0 1 N N N 13.818 1.633  57.573 4.191  -1.150 -0.916 C08    Q16 18 
Q16 C06    C06    C 0 1 Y N N 12.683 1.076  58.454 5.332  -0.306 -0.410 C06    Q16 19 
Q16 N01    N01    N 0 1 Y N N 12.234 -0.186 58.211 6.573  -0.635 -0.719 N01    Q16 20 
Q16 C02    C02    C 0 1 Y N N 11.251 -0.766 58.910 7.606  0.077  -0.296 C02    Q16 21 
Q16 N02    N02    N 0 1 N N N 10.875 -2.024 58.559 8.895  -0.305 -0.646 N02    Q16 22 
Q16 C03    C03    C 0 1 Y N N 10.695 -0.071 60.004 7.411  1.205  0.495  C03    Q16 23 
Q16 C04    C04    C 0 1 Y N N 11.161 1.215  60.297 6.123  1.574  0.836  C04    Q16 24 
Q16 C05    C05    C 0 1 Y N N 12.146 1.797  59.512 5.067  0.803  0.368  C05    Q16 25 
Q16 C07    C07    C 0 1 N N N 10.585 2.019  61.437 5.870  2.789  1.691  C07    Q16 26 
Q16 H021   H021   H 0 0 N N N 11.428 -2.334 57.786 9.035  -1.090 -1.198 H021   Q16 27 
Q16 H022   H022   H 0 0 N N N 11.010 -2.641 59.334 9.655  0.214  -0.339 H022   Q16 28 
Q16 H03    H03    H 0 1 N N N 9.922  -0.525 60.606 8.256  1.784  0.839  H03    Q16 29 
Q16 H071   H071   H 0 0 N N N 11.164 1.825  62.352 5.753  3.665  1.053  H071   Q16 30 
Q16 H072   H072   H 0 0 N N N 10.635 3.090  61.192 4.961  2.640  2.274  H072   Q16 31 
Q16 H073   H073   H 0 0 N N N 9.537  1.728  61.598 6.713  2.941  2.365  H073   Q16 32 
Q16 H05    H05    H 0 1 N N N 12.491 2.799  59.721 4.049  1.065  0.615  H05    Q16 33 
Q16 H081   H081   H 0 0 N N N 14.712 1.029  57.787 4.299  -2.168 -0.544 H081   Q16 34 
Q16 H082   H082   H 0 0 N N N 13.513 1.479  56.527 4.202  -1.158 -2.006 H082   Q16 35 
Q16 H101   H101   H 0 0 N N N 15.813 2.905  59.005 1.859  -2.354 -0.510 H101   Q16 36 
Q16 H102   H102   H 0 0 N N N 16.119 2.275  57.351 1.762  -1.344 -1.973 H102   Q16 37 
Q16 "H2'"  "H2'"  H 0 1 N N N 15.720 5.243  58.111 0.503  0.386  -0.641 "H2'"  Q16 38 
Q16 "H1'"  "H1'"  H 0 1 N N N 15.177 3.904  55.837 0.833  -1.670 1.451  "H1'"  Q16 39 
Q16 "H3'1" "H3'1" H 0 0 N N N 18.018 5.140  58.300 -1.156 -0.900 -1.679 "H3'1" Q16 40 
Q16 "H3'2" "H3'2" H 0 0 N N N 17.994 3.389  57.898 -0.477 -2.439 -1.070 "H3'2" Q16 41 
Q16 "H5'1" "H5'1" H 0 0 N N N 17.150 3.221  55.009 -1.155 -1.023 2.461  "H5'1" Q16 42 
Q16 "H5'2" "H5'2" H 0 0 N N N 17.070 4.891  54.352 -1.210 0.461  1.463  "H5'2" Q16 43 
Q16 "H4'"  "H4'"  H 0 1 N N N 19.146 4.171  55.972 -1.928 -2.375 0.713  "H4'"  Q16 44 
Q16 H121   H121   H 0 0 N N N 20.170 6.483  55.270 -3.872 -0.893 1.823  H121   Q16 45 
Q16 H122   H122   H 0 0 N N N 18.867 6.077  54.102 -4.226 -2.137 0.600  H122   Q16 46 
Q16 H25    H25    H 0 1 N N N 20.870 8.566  54.535 -4.126 0.828  -1.147 H25    Q16 47 
Q16 H271   H271   H 0 0 N N N 20.832 11.326 53.034 -5.841 3.388  -1.758 H271   Q16 48 
Q16 H272   H272   H 0 0 N N N 20.450 12.246 54.529 -5.277 2.133  -2.888 H272   Q16 49 
Q16 H273   H273   H 0 0 N N N 21.621 10.885 54.586 -7.016 2.489  -2.748 H273   Q16 50 
Q16 H23    H23    H 0 1 N N N 18.020 11.806 54.394 -8.300 1.683  -0.812 H23    Q16 51 
Q16 H221   H221   H 0 0 N N N 15.295 9.550  55.125 -9.507 0.404  0.837  H221   Q16 52 
Q16 H222   H222   H 0 0 N N N 15.852 10.984 55.673 -8.772 -0.759 1.802  H222   Q16 53 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
Q16 N02   C02    SING N N 1  
Q16 C02   N01    DOUB Y N 2  
Q16 C02   C03    SING Y N 3  
Q16 N01   C06    SING Y N 4  
Q16 C03   C04    DOUB Y N 5  
Q16 C04   C07    SING N N 6  
Q16 C04   C05    SING Y N 7  
Q16 C05   C06    DOUB Y N 8  
Q16 C06   C08    SING N N 9  
Q16 C08   O09    SING N N 10 
Q16 O09   C10    SING N N 11 
Q16 C10   "C2'"  SING N N 12 
Q16 "C2'" "N1'"  SING N N 13 
Q16 "C2'" "C3'"  SING N N 14 
Q16 "N1'" "C5'"  SING N N 15 
Q16 "C5'" "C4'"  SING N N 16 
Q16 "C3'" "C4'"  SING N N 17 
Q16 "C4'" O11    SING N N 18 
Q16 O11   C12    SING N N 19 
Q16 C12   C26    SING N N 20 
Q16 C26   C25    SING Y N 21 
Q16 C26   N21    DOUB Y N 22 
Q16 C25   C24    DOUB Y N 23 
Q16 C24   C27    SING N N 24 
Q16 C24   C23    SING Y N 25 
Q16 C23   C22    DOUB Y N 26 
Q16 N21   C22    SING Y N 27 
Q16 C22   N22    SING N N 28 
Q16 N02   H021   SING N N 29 
Q16 N02   H022   SING N N 30 
Q16 C03   H03    SING N N 31 
Q16 C07   H071   SING N N 32 
Q16 C07   H072   SING N N 33 
Q16 C07   H073   SING N N 34 
Q16 C05   H05    SING N N 35 
Q16 C08   H081   SING N N 36 
Q16 C08   H082   SING N N 37 
Q16 C10   H101   SING N N 38 
Q16 C10   H102   SING N N 39 
Q16 "C2'" "H2'"  SING N N 40 
Q16 "N1'" "H1'"  SING N N 41 
Q16 "C3'" "H3'1" SING N N 42 
Q16 "C3'" "H3'2" SING N N 43 
Q16 "C5'" "H5'1" SING N N 44 
Q16 "C5'" "H5'2" SING N N 45 
Q16 "C4'" "H4'"  SING N N 46 
Q16 C12   H121   SING N N 47 
Q16 C12   H122   SING N N 48 
Q16 C25   H25    SING N N 49 
Q16 C27   H271   SING N N 50 
Q16 C27   H272   SING N N 51 
Q16 C27   H273   SING N N 52 
Q16 C23   H23    SING N N 53 
Q16 N22   H221   SING N N 54 
Q16 N22   H222   SING N N 55 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
Q16 SMILES           ACDLabs              12.01 "n1c(cc(cc1N)C)COC2CC(NC2)COCc3nc(N)cc(c3)C"                                                                                                                         
Q16 InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C19H27N5O2/c1-12-3-15(23-18(20)5-12)10-25-9-14-7-17(8-22-14)26-11-16-4-13(2)6-19(21)24-16/h3-6,14,17,22H,7-11H2,1-2H3,(H2,20,23)(H2,21,24)/t14-,17+/m1/s1" 
Q16 InChIKey         InChI                1.03  NUKSCYDKRQJOFO-PBHICJAKSA-N                                                                                                                                          
Q16 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "Cc1cc(N)nc(COC[C@H]2C[C@@H](CN2)OCc3cc(C)cc(N)n3)c1"                                                                                                                
Q16 SMILES           CACTVS               3.385 "Cc1cc(N)nc(COC[CH]2C[CH](CN2)OCc3cc(C)cc(N)n3)c1"                                                                                                                   
Q16 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.9.2 "Cc1cc(nc(c1)N)COC[C@H]2C[C@@H](CN2)OCc3cc(cc(n3)N)C"                                                                                                                
Q16 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.9.2 "Cc1cc(nc(c1)N)COCC2CC(CN2)OCc3cc(cc(n3)N)C"                                                                                                                         
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
Q16 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "6-({[(3S,5R)-5-{[(6-amino-4-methylpyridin-2-yl)methoxy]methyl}pyrrolidin-3-yl]oxy}methyl)-4-methylpyridin-2-amine" 
Q16 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.9.2 "6-[[(2R,4S)-4-[(6-azanyl-4-methyl-pyridin-2-yl)methoxy]pyrrolidin-2-yl]methoxymethyl]-4-methyl-pyridin-2-amine"    
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
Q16 "Create component"  2013-08-22 EBI  
Q16 "Initial release"   2014-04-02 RCSB 
Q16 "Modify descriptor" 2014-09-05 RCSB 
# 
