data_9A3
# 
_chem_comp.id                                    9A3 
_chem_comp.name                                  "(2S)-8-benzyl-2-hydroperoxy-6-(4-hydroxyphenyl)-2-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}imidazo[1,2-a]pyrazin-3(2H)-one" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C27 H20 F3 N3 O4" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2018-02-09 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2018-06-01 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        507.461 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     9A3 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5ZAB 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
9A3 C14 C1  C 0 1 Y N N 79.619 -10.832 57.094 1.994  -3.089 0.311  C14 9A3 1  
9A3 C12 C2  C 0 1 N N N 77.377 -10.151 56.184 1.345  -0.718 0.196  C12 9A3 2  
9A3 C10 C3  C 0 1 Y N N 74.533 -14.772 52.087 -4.619 1.826  -0.112 C10 9A3 3  
9A3 C11 C4  C 0 1 N N N 76.670 -11.057 55.248 0.406  0.416  0.197  C11 9A3 4  
9A3 C13 C5  C 0 1 N N N 78.106 -10.846 57.345 0.834  -2.128 0.343  C13 9A3 5  
9A3 C15 C6  C 0 1 Y N N 80.296 -9.633  56.884 2.631  -3.444 1.485  C15 9A3 6  
9A3 C01 C7  C 0 1 N N N 75.369 -11.467 53.405 -0.061 2.610  0.079  C01 9A3 7  
9A3 C02 C8  C 0 1 N N S 75.767 -12.787 54.175 -1.345 1.825  0.249  C02 9A3 8  
9A3 C03 C9  C 0 1 N N N 76.558 -13.826 53.304 -2.270 2.044  -0.950 C03 9A3 9  
9A3 C04 C10 C 0 1 Y N N 75.773 -14.135 52.033 -3.539 1.253  -0.757 C04 9A3 10 
9A3 C05 C11 C 0 1 Y N N 76.280 -13.755 50.805 -3.621 -0.046 -1.224 C05 9A3 11 
9A3 C06 C12 C 0 1 Y N N 75.567 -14.012 49.650 -4.785 -0.771 -1.047 C06 9A3 12 
9A3 C07 C13 C 0 1 Y N N 74.348 -14.644 49.708 -5.865 -0.198 -0.403 C07 9A3 13 
9A3 C08 C14 C 0 1 N N N 73.563 -14.910 48.398 -7.134 -0.988 -0.210 C08 9A3 14 
9A3 C09 C15 C 0 1 Y N N 73.816 -15.019 50.929 -5.780 1.099  0.070  C09 9A3 15 
9A3 C16 C16 C 0 1 Y N N 81.667 -9.613  56.659 3.695  -4.325 1.455  C16 9A3 16 
9A3 C17 C17 C 0 1 Y N N 82.383 -10.802 56.629 4.123  -4.851 0.251  C17 9A3 17 
9A3 C18 C18 C 0 1 Y N N 81.704 -11.995 56.840 3.486  -4.497 -0.924 C18 9A3 18 
9A3 C19 C19 C 0 1 Y N N 80.337 -12.018 57.078 2.418  -3.620 -0.893 C19 9A3 19 
9A3 C20 C20 C 0 1 N N N 76.678 -8.305  54.892 3.102  0.755  -0.070 C20 9A3 20 
9A3 C21 C21 C 0 1 N N N 76.007 -9.051  54.016 2.284  1.838  -0.072 C21 9A3 21 
9A3 C22 C22 C 0 1 Y N N 76.722 -6.817  54.805 4.564  0.954  -0.219 C22 9A3 22 
9A3 C23 C23 C 0 1 Y N N 77.730 -6.107  55.451 5.422  -0.144 -0.220 C23 9A3 23 
9A3 C24 C24 C 0 1 Y N N 77.760 -4.726  55.382 6.781  0.044  -0.359 C24 9A3 24 
9A3 C25 C25 C 0 1 Y N N 76.775 -4.025  54.685 7.295  1.327  -0.498 C25 9A3 25 
9A3 C26 C26 C 0 1 Y N N 75.755 -4.729  54.039 6.443  2.423  -0.497 C26 9A3 26 
9A3 C27 C27 C 0 1 Y N N 75.733 -6.108  54.106 5.082  2.240  -0.364 C27 9A3 27 
9A3 F01 F1  F 0 1 N N N 74.358 -14.750 47.291 -7.073 -1.678 1.006  F01 9A3 28 
9A3 F02 F2  F 0 1 N N N 73.009 -16.167 48.343 -8.229 -0.118 -0.198 F02 9A3 29 
9A3 F03 F3  F 0 1 N N N 72.544 -14.000 48.287 -7.277 -1.903 -1.258 F03 9A3 30 
9A3 N01 N1  N 0 1 N N N 76.002 -10.440 54.181 0.924  1.687  0.059  N01 9A3 31 
9A3 N02 N2  N 0 1 N N N 76.612 -12.339 55.326 -0.900 0.426  0.311  N02 9A3 32 
9A3 N03 N3  N 0 1 N N N 77.383 -8.875  56.028 2.623  -0.492 0.062  N03 9A3 33 
9A3 O01 O1  O 0 1 N N N 74.687 -11.279 52.412 0.056  3.812  -0.019 O01 9A3 34 
9A3 O02 O2  O 0 1 N N N 74.615 -13.472 54.719 -2.003 2.195  1.462  O02 9A3 35 
9A3 O03 O3  O 0 1 N N N 73.486 -12.868 54.167 -1.158 2.082  2.658  O03 9A3 36 
9A3 O04 O4  O 0 1 N N N 76.753 -2.638  54.585 8.634  1.509  -0.634 O04 9A3 37 
9A3 H1  H1  H 0 1 N N N 74.129 -15.075 53.041 -4.554 2.840  0.253  H1  9A3 38 
9A3 H2  H2  H 0 1 N N N 77.887 -10.315 58.283 0.151  -2.354 -0.476 H2  9A3 39 
9A3 H3  H3  H 0 1 N N N 77.759 -11.887 57.423 0.307  -2.226 1.292  H3  9A3 40 
9A3 H4  H4  H 0 1 N N N 79.746 -8.703  56.896 2.297  -3.032 2.426  H4  9A3 41 
9A3 H5  H5  H 0 1 N N N 76.701 -14.752 53.880 -2.512 3.103  -1.033 H5  9A3 42 
9A3 H6  H6  H 0 1 N N N 77.539 -13.406 53.035 -1.770 1.712  -1.860 H6  9A3 43 
9A3 H7  H7  H 0 1 N N N 77.236 -13.256 50.748 -2.777 -0.493 -1.727 H7  9A3 44 
9A3 H8  H8  H 0 1 N N N 75.971 -13.714 48.694 -4.851 -1.784 -1.416 H8  9A3 45 
9A3 H9  H9  H 0 1 N N N 72.850 -15.500 50.978 -6.624 1.546  0.573  H9  9A3 46 
9A3 H10 H10 H 0 1 N N N 82.176 -8.672  56.507 4.193  -4.602 2.373  H10 9A3 47 
9A3 H11 H11 H 0 1 N N N 83.447 -10.799 56.445 4.955  -5.539 0.228  H11 9A3 48 
9A3 H12 H12 H 0 1 N N N 82.252 -12.925 56.818 3.821  -4.908 -1.865 H12 9A3 49 
9A3 H13 H13 H 0 1 N N N 79.833 -12.958 57.250 1.920  -3.343 -1.811 H13 9A3 50 
9A3 H14 H14 H 0 1 N N N 75.477 -8.592  53.194 2.705  2.826  -0.180 H14 9A3 51 
9A3 H15 H15 H 0 1 N N N 78.490 -6.636  56.007 5.023  -1.142 -0.112 H15 9A3 52 
9A3 H16 H16 H 0 1 N N N 78.555 -4.184  55.873 7.446  -0.806 -0.360 H16 9A3 53 
9A3 H17 H17 H 0 1 N N N 74.990 -4.199  53.492 6.845  3.419  -0.609 H17 9A3 54 
9A3 H18 H18 H 0 1 N N N 74.941 -6.651  53.612 4.420  3.093  -0.363 H18 9A3 55 
9A3 H20 H20 H 0 1 N N N 73.753 -12.249 53.498 -1.602 2.333  3.479  H20 9A3 56 
9A3 H21 H21 H 0 1 N N N 77.490 -2.274  55.061 8.941  1.500  -1.551 H21 9A3 57 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
9A3 F01 C08 SING N N 1  
9A3 F03 C08 SING N N 2  
9A3 F02 C08 SING N N 3  
9A3 C08 C07 SING N N 4  
9A3 C06 C07 DOUB Y N 5  
9A3 C06 C05 SING Y N 6  
9A3 C07 C09 SING Y N 7  
9A3 C05 C04 DOUB Y N 8  
9A3 C09 C10 DOUB Y N 9  
9A3 C04 C10 SING Y N 10 
9A3 C04 C03 SING N N 11 
9A3 O01 C01 DOUB N N 12 
9A3 C03 C02 SING N N 13 
9A3 C01 C02 SING N N 14 
9A3 C01 N01 SING N N 15 
9A3 C21 N01 SING N N 16 
9A3 C21 C20 DOUB N N 17 
9A3 C26 C27 DOUB Y N 18 
9A3 C26 C25 SING Y N 19 
9A3 C27 C22 SING Y N 20 
9A3 O03 O02 SING N N 21 
9A3 C02 O02 SING N N 22 
9A3 C02 N02 SING N N 23 
9A3 N01 C11 SING N N 24 
9A3 O04 C25 SING N N 25 
9A3 C25 C24 DOUB Y N 26 
9A3 C22 C20 SING N N 27 
9A3 C22 C23 DOUB Y N 28 
9A3 C20 N03 SING N N 29 
9A3 C11 N02 DOUB N N 30 
9A3 C11 C12 SING N N 31 
9A3 C24 C23 SING Y N 32 
9A3 N03 C12 DOUB N N 33 
9A3 C12 C13 SING N N 34 
9A3 C17 C16 DOUB Y N 35 
9A3 C17 C18 SING Y N 36 
9A3 C16 C15 SING Y N 37 
9A3 C18 C19 DOUB Y N 38 
9A3 C15 C14 DOUB Y N 39 
9A3 C19 C14 SING Y N 40 
9A3 C14 C13 SING N N 41 
9A3 C10 H1  SING N N 42 
9A3 C13 H2  SING N N 43 
9A3 C13 H3  SING N N 44 
9A3 C15 H4  SING N N 45 
9A3 C03 H5  SING N N 46 
9A3 C03 H6  SING N N 47 
9A3 C05 H7  SING N N 48 
9A3 C06 H8  SING N N 49 
9A3 C09 H9  SING N N 50 
9A3 C16 H10 SING N N 51 
9A3 C17 H11 SING N N 52 
9A3 C18 H12 SING N N 53 
9A3 C19 H13 SING N N 54 
9A3 C21 H14 SING N N 55 
9A3 C23 H15 SING N N 56 
9A3 C24 H16 SING N N 57 
9A3 C26 H17 SING N N 58 
9A3 C27 H18 SING N N 59 
9A3 O03 H20 SING N N 60 
9A3 O04 H21 SING N N 61 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
9A3 SMILES           ACDLabs              12.01 "c5(CC=2C1=NC(C(N1C=C(N=2)c3ccc(cc3)O)=O)(OO)Cc4ccc(cc4)C(F)(F)F)ccccc5"                                                                                                         
9A3 InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C27H20F3N3O4/c28-27(29,30)20-10-6-18(7-11-20)15-26(37-36)25(35)33-16-23(19-8-12-21(34)13-9-19)31-22(24(33)32-26)14-17-4-2-1-3-5-17/h1-13,16,34,36H,14-15H2/t26-/m0/s1" 
9A3 InChIKey         InChI                1.03  ISIFAODRJRHDGD-SANMLTNESA-N                                                                                                                                                      
9A3 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "OO[C@]1(Cc2ccc(cc2)C(F)(F)F)N=C3N(C=C(N=C3Cc4ccccc4)c5ccc(O)cc5)C1=O"                                                                                                           
9A3 SMILES           CACTVS               3.385 "OO[C]1(Cc2ccc(cc2)C(F)(F)F)N=C3N(C=C(N=C3Cc4ccccc4)c5ccc(O)cc5)C1=O"                                                                                                            
9A3 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "c1ccc(cc1)CC2=NC(=CN3C2=N[C@@](C3=O)(Cc4ccc(cc4)C(F)(F)F)OO)c5ccc(cc5)O"                                                                                                        
9A3 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "c1ccc(cc1)CC2=NC(=CN3C2=NC(C3=O)(Cc4ccc(cc4)C(F)(F)F)OO)c5ccc(cc5)O"                                                                                                            
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
9A3 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "(2S)-8-benzyl-2-hydroperoxy-6-(4-hydroxyphenyl)-2-{[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl}imidazo[1,2-a]pyrazin-3(2H)-one"         
9A3 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "(2~{S})-2-(dioxidanyl)-6-(4-hydroxyphenyl)-8-(phenylmethyl)-2-[[4-(trifluoromethyl)phenyl]methyl]imidazo[1,2-a]pyrazin-3-one" 
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loop_
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_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
9A3 "Create component" 2018-02-09 RCSB 
9A3 "Initial release"  2018-06-06 RCSB 
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