data_D20
# 
_chem_comp.id                                    D20 
_chem_comp.name                                  "N~5~-{IMINO[(2-METHOXYETHYL)AMINO]METHYL}-L-ORNITHINE" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C9 H20 N4 O3" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2006-11-29 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2011-06-04 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   ? 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        232.280 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     D20 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        2JAJ 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
D20 N    N    N 0 1 N N N 15.962 4.316 67.613 -0.962 2.464  -2.885 N    D20 1  
D20 C1   C1   C 0 1 N N S 16.244 5.258 66.518 -0.675 1.470  -3.919 C1   D20 2  
D20 C    C    C 0 1 N N N 15.088 6.212 66.179 -1.163 0.119  -3.424 C    D20 3  
D20 O    O    O 0 1 N N N 14.011 6.072 66.811 -1.639 -0.103 -2.319 O    D20 4  
D20 C2   C2   C 0 1 N N N 16.685 4.449 65.276 0.818  1.445  -4.279 C2   D20 5  
D20 C3   C3   C 0 1 N N N 15.621 3.416 64.924 1.745  1.017  -3.130 C3   D20 6  
D20 C4   C4   C 0 1 N N N 16.034 2.629 63.639 3.210  0.954  -3.557 C4   D20 7  
D20 N5   N5   N 0 1 N N N 16.227 3.468 62.415 4.052  0.545  -2.458 N5   D20 8  
D20 C6   C6   C 0 1 N N N 15.228 3.801 61.582 5.426  0.397  -2.509 C6   D20 9  
D20 N61  N61  N 0 1 N N N 13.957 3.355 61.871 5.948  -0.005 -1.293 N61  D20 10 
D20 N62  N62  N 0 1 N N N 15.539 4.533 60.484 6.162  0.606  -3.566 N62  D20 11 
D20 C7   C7   C 0 1 N N N 12.784 3.654 61.054 7.348  -0.246 -1.041 C7   D20 12 
D20 C8   C8   C 0 1 N N N 13.533 1.750 58.059 7.255  -0.070 2.637  C8   D20 13 
D20 O9   O9   O 0 1 N N N 15.317 7.069 65.279 -1.014 -0.850 -4.366 O9   D20 14 
D20 O10  O10  O 0 1 N N N 13.538 2.915 58.932 7.094  0.314  1.279  O10  D20 15 
D20 C10  C10  C 0 1 N N N 12.560 2.634 59.950 7.535  -0.707 0.393  C10  D20 16 
D20 HN1  1HN  H 0 1 N N N 15.113 3.787 67.415 -0.824 3.424  -3.110 HN1  D20 17 
D20 HN2  2HN  H 0 1 N N N 16.729 3.683 67.838 -1.084 2.143  -1.950 HN2  D20 18 
D20 H1   H1   H 0 1 N N N 17.062 5.932 66.865 -1.263 1.736  -4.805 H1   D20 19 
D20 H2C1 1H2C H 0 0 N N N 17.689 3.985 65.414 1.116  2.441  -4.629 H2C1 D20 20 
D20 H2C2 2H2C H 0 0 N N N 16.929 5.109 64.412 0.966  0.765  -5.128 H2C2 D20 21 
D20 H9   H9   H 0 1 N N N 14.602 7.659 65.069 -1.316 -1.744 -4.098 H9   D20 22 
D20 H3C1 1H3C H 0 0 N N N 14.611 3.877 64.823 1.452  0.023  -2.774 H3C1 D20 23 
D20 H3C2 2H3C H 0 0 N N N 15.405 2.733 65.779 1.639  1.708  -2.285 H3C2 D20 24 
D20 H4C1 1H4C H 0 0 N N N 15.300 1.815 63.435 3.323  0.229  -4.371 H4C1 D20 25 
D20 H4C2 2H4C H 0 0 N N N 16.948 2.023 63.837 3.543  1.926  -3.935 H4C2 D20 26 
D20 H5   H5   H 0 1 N N N 16.953 3.023 61.854 3.579  0.356  -1.580 H5   D20 27 
D20 H61  H61  H 0 1 N N N 13.744 3.653 62.823 5.314  -0.148 -0.512 H61  D20 28 
D20 H62  H62  H 0 1 N N N 16.133 4.606 61.310 7.146  0.427  -3.344 H62  D20 29 
D20 H7C1 1H7C H 0 0 N N N 12.840 4.687 60.638 7.896  0.681  -1.234 H7C1 D20 30 
D20 H7C2 2H7C H 0 0 N N N 11.873 3.763 61.688 7.692  -1.017 -1.737 H7C2 D20 31 
D20 H101 1H10 H 0 0 N N N 11.513 2.621 59.566 8.595  -0.893 0.592  H101 D20 32 
D20 H102 2H10 H 0 0 N N N 12.588 1.579 60.310 6.968  -1.621 0.599  H102 D20 33 
D20 H8C1 1H8C H 0 0 N N N 12.525 1.496 57.655 7.102  -1.148 2.733  H8C1 D20 34 
D20 H8C2 2H8C H 0 0 N N N 13.706 0.787 58.594 6.533  0.468  3.257  H8C2 D20 35 
D20 H8C3 3H8C H 0 0 N N N 14.291 1.968 57.270 8.268  0.182  2.960  H8C3 D20 36 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
D20 N   C1   SING N N 1  
D20 N   HN1  SING N N 2  
D20 N   HN2  SING N N 3  
D20 C1  C    SING N N 4  
D20 C1  C2   SING N N 5  
D20 C1  H1   SING N N 6  
D20 C   O    DOUB N N 7  
D20 C   O9   SING N N 8  
D20 C2  C3   SING N N 9  
D20 C2  H2C1 SING N N 10 
D20 C2  H2C2 SING N N 11 
D20 C3  C4   SING N N 12 
D20 C3  H3C1 SING N N 13 
D20 C3  H3C2 SING N N 14 
D20 C4  N5   SING N N 15 
D20 C4  H4C1 SING N N 16 
D20 C4  H4C2 SING N N 17 
D20 N5  C6   SING N N 18 
D20 N5  H5   SING N N 19 
D20 C6  N61  SING N N 20 
D20 C6  N62  DOUB N N 21 
D20 N61 C7   SING N N 22 
D20 N61 H61  SING N N 23 
D20 N62 H62  SING N N 24 
D20 C7  C10  SING N N 25 
D20 C7  H7C1 SING N N 26 
D20 C7  H7C2 SING N N 27 
D20 C8  O10  SING N N 28 
D20 C8  H8C1 SING N N 29 
D20 C8  H8C2 SING N N 30 
D20 C8  H8C3 SING N N 31 
D20 O9  H9   SING N N 32 
D20 O10 C10  SING N N 33 
D20 C10 H101 SING N N 34 
D20 C10 H102 SING N N 35 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
D20 SMILES           ACDLabs              10.04 "O=C(O)C(N)CCCNC(=[N@H])NCCOC"                                                                                 
D20 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.341 "COCCNC(=N)NCCC[C@H](N)C(O)=O"                                                                                 
D20 SMILES           CACTVS               3.341 "COCCNC(=N)NCCC[CH](N)C(O)=O"                                                                                  
D20 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "COCCNC(=N)NCCC[C@@H](C(=O)O)N"                                                                                
D20 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "COCCNC(=N)NCCCC(C(=O)O)N"                                                                                     
D20 InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C9H20N4O3/c1-16-6-5-13-9(11)12-4-2-3-7(10)8(14)15/h7H,2-6,10H2,1H3,(H,14,15)(H3,11,12,13)/t7-/m0/s1" 
D20 InChIKey         InChI                1.03  XMBSMMCPKFDGEO-ZETCQYMHSA-N                                                                                    
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
D20 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              10.04 "N~5~-[N-(2-methoxyethyl)carbamimidoyl]-L-ornithine"                    
D20 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "(2S)-2-amino-5-[(N-(2-methoxyethyl)carbamimidoyl)amino]pentanoic acid" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
D20 "Create component"  2006-11-29 RCSB 
D20 "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB 
# 
