data_6G0
# 
_chem_comp.id                                    6G0 
_chem_comp.name                                  "5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]-7-methylguanosine" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C11 H20 N5 O17 P4" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    1 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2016-04-04 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2017-05-05 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        618.195 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     6G0 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5J5O 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  EBI 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
6G0 C1  C2  C 0 1 N N N -74.493 73.024 -20.965 8.026  2.116  -0.809 C1  6G0 1  
6G0 C2  C8  C 0 1 Y N N -73.091 68.837 -20.331 4.692  0.157  1.390  C2  6G0 2  
6G0 N1  N1  N 0 1 N N N -73.154 73.255 -20.991 8.464  2.390  0.452  N1  6G0 3  
6G0 N2  N2  N 0 1 N N N -75.369 74.047 -21.124 8.771  2.541  -1.881 N2  6G0 4  
6G0 N3  N3  N 0 1 N N N -74.985 71.774 -20.791 6.913  1.452  -1.029 N3  6G0 5  
6G0 C3  C4  C 0 1 Y N N -74.126 70.747 -20.638 6.157  1.014  -0.016 C3  6G0 6  
6G0 C4  C5  C 0 1 Y N N -72.768 70.967 -20.646 6.554  1.263  1.303  C4  6G0 7  
6G0 C5  C6  C 0 1 N N N -72.264 72.252 -20.830 7.754  1.979  1.525  C5  6G0 8  
6G0 O1  O5P O 0 1 N N N -73.497 59.698 -25.457 -8.561 2.569  -0.152 O1  6G0 9  
6G0 P1  PA  P 0 1 N N N -74.038 59.192 -24.024 -7.406 2.491  -1.074 P1  6G0 10 
6G0 O2  OA1 O 0 1 N N N -72.901 58.601 -23.233 -7.820 1.649  -2.383 O2  6G0 11 
6G0 O3  OA2 O 0 1 N N N -75.110 58.150 -24.238 -6.964 3.977  -1.509 O3  6G0 12 
6G0 O4  OAB O 0 1 N N N -74.715 60.420 -23.219 -6.176 1.761  -0.334 O4  6G0 13 
6G0 P2  PB  P 0 1 N N N -73.901 61.762 -22.844 -6.045 0.444  0.583  P2  6G0 14 
6G0 O5  OB2 O 0 1 N N N -74.467 62.932 -23.610 -6.813 -0.663 -0.031 O5  6G0 15 
6G0 O6  OB1 O 0 1 N N N -72.428 61.577 -23.169 -6.629 0.752  2.052  O6  6G0 16 
6G0 O7  OBC O 0 1 N N N -74.191 62.022 -21.279 -4.496 0.022  0.699  O7  6G0 17 
6G0 P3  PC  P 0 1 N N N -73.070 62.136 -20.152 -3.734 -1.342 1.087  P3  6G0 18 
6G0 O8  OC2 O 0 1 N N N -73.777 62.346 -18.833 -3.822 -1.572 2.678  O8  6G0 19 
6G0 O9  OC1 O 0 1 N N N -72.233 60.895 -20.040 -4.373 -2.480 0.388  O9  6G0 20 
6G0 O10 OCD O 0 1 N N N -72.114 63.364 -20.538 -2.190 -1.239 0.644  O10 6G0 21 
6G0 P4  PD  P 0 1 N N N -72.362 64.882 -20.071 -1.031 -2.322 0.366  P4  6G0 22 
6G0 O11 OD1 O 0 1 N N N -71.127 65.633 -20.545 -1.576 -3.427 -0.454 O11 6G0 23 
6G0 O12 OD2 O 0 1 N N N -72.577 64.951 -18.584 -0.496 -2.907 1.767  O12 6G0 24 
6G0 O13 O5* O 0 1 N N N -73.655 65.540 -20.789 0.184  -1.618 -0.421 O13 6G0 25 
6G0 C6  C5* C 0 1 N N N -74.983 65.275 -20.360 1.319  -2.339 -0.905 C6  6G0 26 
6G0 C7  C4* C 0 1 N N R -75.863 66.505 -20.597 2.279  -1.371 -1.601 C7  6G0 27 
6G0 O14 O4* O 0 1 N N N -75.499 67.547 -19.701 2.833  -0.457 -0.640 O14 6G0 28 
6G0 C8  C3* C 0 1 N N S -75.678 67.128 -21.963 3.454  -2.153 -2.220 C8  6G0 29 
6G0 O15 O3* O 0 1 N N N -76.481 66.468 -22.939 3.497  -1.954 -3.634 O15 6G0 30 
6G0 C9  C2* C 0 1 N N R -76.172 68.529 -21.750 4.709  -1.546 -1.548 C9  6G0 31 
6G0 O16 O2* O 0 1 N N N -77.604 68.497 -21.719 5.766  -1.382 -2.496 O16 6G0 32 
6G0 C10 C1* C 0 1 N N R -75.657 68.808 -20.350 4.184  -0.171 -1.061 C10 6G0 33 
6G0 N4  N9  N 0 1 Y N N -74.311 69.435 -20.439 4.983  0.316  0.066  N4  6G0 34 
6G0 N5  N7  N 1 1 Y N N -72.131 69.788 -20.460 5.617  0.715  2.115  N5  6G0 35 
6G0 C11 CM7 C 0 1 N N N -70.664 69.544 -20.420 5.643  0.746  3.579  C11 6G0 36 
6G0 O17 O6  O 0 1 N N N -70.962 72.528 -20.861 8.138  2.218  2.658  O17 6G0 37 
6G0 H1  H1  H 0 1 N N N -72.917 67.783 -20.170 3.824  -0.354 1.778  H1  6G0 38 
6G0 H2  H2  H 0 1 N N N -72.821 74.187 -21.132 9.290  2.883  0.580  H2  6G0 39 
6G0 H3  H3  H 0 1 N N N -76.353 73.869 -21.111 8.474  2.350  -2.784 H3  6G0 40 
6G0 H4  H4  H 0 1 N N N -75.031 74.979 -21.254 9.595  3.032  -1.734 H4  6G0 41 
6G0 H5  H5  H 0 1 N N N -72.101 58.649 -23.743 -7.110 1.557  -3.032 H5  6G0 42 
6G0 H6  H6  H 0 1 N N N -75.238 58.014 -25.169 -7.657 4.476  -1.962 H6  6G0 43 
6G0 H7  H7  H 0 1 N N N -72.155 62.239 -23.794 -6.172 1.468  2.514  H7  6G0 44 
6G0 H8  H8  H 0 1 N N N -73.537 61.652 -18.230 -3.422 -0.863 3.200  H8  6G0 45 
6G0 H9  H9  H 0 1 N N N -71.885 65.466 -18.187 -0.125 -2.237 2.357  H9  6G0 46 
6G0 H10 H10 H 0 1 N N N -75.386 64.423 -20.927 1.829  -2.817 -0.069 H10 6G0 47 
6G0 H11 H11 H 0 1 N N N -74.978 65.032 -19.287 0.992  -3.099 -1.614 H11 6G0 48 
6G0 H12 H12 H 0 1 N N N -76.918 66.226 -20.462 1.749  -0.818 -2.377 H12 6G0 49 
6G0 H13 H13 H 0 1 N N N -74.614 67.130 -22.244 3.371  -3.215 -1.985 H13 6G0 50 
6G0 H14 H14 H 0 1 N N N -76.161 65.583 -23.067 4.251  -2.376 -4.068 H14 6G0 51 
6G0 H15 H15 H 0 1 N N N -75.765 69.234 -22.490 5.035  -2.159 -0.707 H15 6G0 52 
6G0 H16 H16 H 0 1 N N N -77.938 69.376 -21.585 6.067  -2.209 -2.896 H16 6G0 53 
6G0 H17 H17 H 0 1 N N N -76.357 69.460 -19.807 4.188  0.552  -1.876 H17 6G0 54 
6G0 H18 H18 H 0 1 N N N -70.474 68.474 -20.252 5.124  1.637  3.933  H18 6G0 55 
6G0 H19 H19 H 0 1 N N N -70.215 69.850 -21.377 5.147  -0.142 3.970  H19 6G0 56 
6G0 H20 H20 H 0 1 N N N -70.217 70.129 -19.602 6.677  0.767  3.924  H20 6G0 57 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
6G0 O1  P1  DOUB N N 1  
6G0 O3  P1  SING N N 2  
6G0 P1  O2  SING N N 3  
6G0 P1  O4  SING N N 4  
6G0 O5  P2  DOUB N N 5  
6G0 O4  P2  SING N N 6  
6G0 O6  P2  SING N N 7  
6G0 O15 C8  SING N N 8  
6G0 P2  O7  SING N N 9  
6G0 C8  C9  SING N N 10 
6G0 C8  C7  SING N N 11 
6G0 C9  O16 SING N N 12 
6G0 C9  C10 SING N N 13 
6G0 O7  P3  SING N N 14 
6G0 N2  C1  SING N N 15 
6G0 N1  C1  SING N N 16 
6G0 N1  C5  SING N N 17 
6G0 C1  N3  DOUB N N 18 
6G0 O17 C5  DOUB N N 19 
6G0 C5  C4  SING N N 20 
6G0 N3  C3  SING N N 21 
6G0 O13 C6  SING N N 22 
6G0 O13 P4  SING N N 23 
6G0 C4  C3  DOUB Y N 24 
6G0 C4  N5  SING Y N 25 
6G0 C3  N4  SING Y N 26 
6G0 C7  C6  SING N N 27 
6G0 C7  O14 SING N N 28 
6G0 O11 P4  DOUB N N 29 
6G0 O10 P3  SING N N 30 
6G0 O10 P4  SING N N 31 
6G0 N5  C11 SING N N 32 
6G0 N5  C2  DOUB Y N 33 
6G0 N4  C10 SING N N 34 
6G0 N4  C2  SING Y N 35 
6G0 C10 O14 SING N N 36 
6G0 P3  O9  DOUB N N 37 
6G0 P3  O8  SING N N 38 
6G0 P4  O12 SING N N 39 
6G0 C2  H1  SING N N 40 
6G0 N1  H2  SING N N 41 
6G0 N2  H3  SING N N 42 
6G0 N2  H4  SING N N 43 
6G0 O2  H5  SING N N 44 
6G0 O3  H6  SING N N 45 
6G0 O6  H7  SING N N 46 
6G0 O8  H8  SING N N 47 
6G0 O12 H9  SING N N 48 
6G0 C6  H10 SING N N 49 
6G0 C6  H11 SING N N 50 
6G0 C7  H12 SING N N 51 
6G0 C8  H13 SING N N 52 
6G0 O15 H14 SING N N 53 
6G0 C9  H15 SING N N 54 
6G0 O16 H16 SING N N 55 
6G0 C10 H17 SING N N 56 
6G0 C11 H18 SING N N 57 
6G0 C11 H19 SING N N 58 
6G0 C11 H20 SING N N 59 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
6G0 SMILES           ACDLabs              12.01 "C2(=Nc1n(c[n+](c1C(N2)=O)C)C3OC(COP(OP(OP(OP(=O)(O)O)(=O)O)(=O)O)(O)=O)C(C3O)O)N" 
6G0 InChI            InChI                1.03  
"InChI=1S/C11H19N5O17P4/c1-15-3-16(8-5(15)9(19)14-11(12)13-8)10-7(18)6(17)4(30-10)2-29-35(23,24)32-37(27,28)33-36(25,26)31-34(20,21)22/h3-4,6-7,10,17-18H,2H2,1H3,(H7-,12,13,14,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28)/p+1/t4-,6-,7-,10-/m1/s1" 
6G0 InChIKey         InChI                1.03  ICYVMAXYRWTAKS-KQYNXXCUSA-O 
6G0 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "C[n+]1cn([C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)c3N=C(N)NC(=O)c13" 
6G0 SMILES           CACTVS               3.385 "C[n+]1cn([CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]2O)c3N=C(N)NC(=O)c13" 
6G0 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "C[n+]1cn(c2c1C(=O)NC(=N2)N)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O" 
6G0 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "C[n+]1cn(c2c1C(=O)NC(=N2)N)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
6G0 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]oxy}phosphoryl]-7-methylguanosine"                                                                                     
6G0 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-7-ium-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl] hydrogen phosphate" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
6G0 "Create component" 2016-04-04 EBI  
6G0 "Initial release"  2017-05-10 RCSB 
# 
